Qinchuanウシにおけるその発現パターンに及ぼすHGF遺伝子内のSNPと選択的スプライシングの影響【Powered by NICT】

Cai Hanfang; Zhou Yang; Jia Wenchao; Zhang Bowen; Lan Xianyong; Lei Chuzhao; Fang Xintang; Chen Hong

文献

J-GLOBAL ID：201702263757258821 整理番号：17A0124872

Qinchuanウシにおけるその発現パターンに及ぼすHGF遺伝子内のSNPと選択的スプライシングの影響【Powered by NICT】

Effects of SNPs and alternative splicing within HGF gene on its expression patterns in Qinchuan cattle

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資料名：
巻： 7 号： 2 ページ： 134-140 発行年： 2016年
JST資料番号： C2841A ISSN： 1674-9782 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：英語 (EN)

背景:機能的遺伝子内のSNPs(一塩基多型),CNV(コピー数多型)と選択的スプライシングを含む,遺伝的変異体の同定は,動物科学研究でますます注目を集めている。HGF(肝細胞成長因子)はマイトジェンまたは組織成長,発生と再生時のモルフォゲンとして働くことを非常に重要な成長因子である。しかし,今日まで,特にmRNA発現に及ぼすそれらの影響,ウシH GF遺伝子内の遺伝的変異体の機能は十分に決定されていない。【結果】本研究では,種々の戦略を用いたQinchuanウシにおけるウシH GF遺伝子,PCR-RFLP(制限酵素断片長多型),qPCR(定量的リアルタイム定量的PCR),TAクローニング,DNA配列決定とバイオインフォマティクス解析を含む遺伝的変異体とm RNA発現の間の関連分析を行うことを目的とした。全部で五のSNPが同定され,のみSV1遺伝子座は有意に胎児骨格筋(P<0.05)におけるHGFのmRNA発現に影響を及ぼした。ヘテロ接合遺伝子型個体は有意に高いHGF発現(P<0.05)であり,「CCCCGGGGTT」複合遺伝子型(P<0.05)より「CTCCAGGGTT」複合遺伝子型で有意に大きいを示した。添加では,二種の代替スプライシング変化,HGF WとH GF M,が同定され,エキソン5の選択的3′スプライス部位から生じ,HGF Wは全ての組織におけるHGF Mより高いmRNAレベルを示した。【結論】要約すると,HGF遺伝子内の遺伝的変異はm RNA発現に影響を及ぼした。これらの知見は,ウシHGFの分子特性と機能に関する新しい洞察を提供する。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

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遺伝子発現

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