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J-GLOBAL ID：201702263926777842   整理番号：17A0475366

近傍ラフ集合とエントロピー測度を用いた腫瘍分類のための遺伝子選択【Powered by NICT】

Gene selection for tumor classification using neighborhood rough sets and entropy measures

著者 (5件)： Chen Yumin (College of Computer & Information Engineering, Xiamen University of Technology, Xiamen 361024, China) ,  Zhang Zunjun (Department of Urinary Surgery, The Third Xiamen Hospital of Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Xiamen 316000, China) ,  Zheng Jianzhong (Department of Urinary Surgery, The Third Xiamen Hospital of Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Xiamen 316000, China) ,  Ma Ying (College of Computer & Information Engineering, Xiamen University of Technology, Xiamen 361024, China) ,  Xue Yu (School of Computer & Software, Nanjing University of Information Science & Technology, Nanjing 210044, China)
資料名： Journal of Biomedical Informatics  (Journal of Biomedical Informatics)
巻： 67  ページ： 59-68  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0827A  ISSN： 1532-0464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： バイオインフォマティクスの発展に伴い,遺伝子発現データからの腫瘍分類は癌診断のための重要な有用な技術となっている。遺伝子発現データは千遺伝子と少数の試料を含んでいるので,遺伝子発現データからの遺伝子選択は腫瘍分類のための重要段階となった。ラフ集合の属性縮約は遺伝子選択場に成功裏に適用された,データ駆動と追加情報を必要としないという特徴を有する。しかし,伝統的なラフ集合法は離散データのみを対象としている。実数値あるいは雑音のあるデータを含む遺伝子発現データに関しては,それらは通常離散前処理,貧弱な分類精度をもたらすことによって使用した。本論文では,近傍ラフ集合モデルに基づく新しい遺伝子選択法,元の遺伝子分類情報を維持しながら,実数値データを処理する能力を有することを提案した。さらに,本論文では,不確実性と遺伝子発現データの雑音を取り組むためにラフ集合を近隣の枠組み下でのエントロピー測度を検討した。この測度を用いて,小型遺伝子サブセットの発見をもたらすことができる。最後に,近傍粒とエントロピー測度に基づいて設計した遺伝子選択アルゴリズム。二遺伝子発現データに関するいくつかの実験は,提案した遺伝子選択は腫瘍分類の精度を改善するための有効な方法であることを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 不確実性 ,  *遺伝子 ,  *エントロピー ,  部分集合 ,  *測度 ,  前処理 ,  *ラフ集合 ,  実数
準シソーラス用語： 分類精度 ,  データ駆動 ,  癌診断 ,  遺伝子発現データ ,  バイオインフォマティクス ,  *遺伝子選択 ,  *腫瘍分類 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝子選択 ,  近傍ラフ集合 ,  腫瘍分類 ,  エントロピー測度 ,  遺伝子発現データ

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 近傍 ,  ラフ集合 ,  エントロピー ,  測度 ,  腫瘍分類 ,  遺伝子選択