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J-GLOBAL ID：201702264664194431   整理番号：17A0056199

HIVの逆転写酵素に対する強力な阻害剤を提案のためのFMO法に基づくab initio分子シミュレーション【Powered by NICT】

Ab initio molecular simulations based on FMO method for proposing potent inhibitors to reverse transcriptase of HIV

著者 (7件)： Takeda Ryosuke (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Tempaku-cho, Aichi, 441-8580, Japan) ,  Kadoya Ryushi (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Tempaku-cho, Aichi, 441-8580, Japan) ,  Kobayashi Ittetsu (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Tempaku-cho, Aichi, 441-8580, Japan) ,  Kurita Noriyuki (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Tempaku-cho, Aichi, 441-8580, Japan) ,  Kamsri Pharit (Department of Chemistry, Faculty of Science, Ubon Ratchathani University, 85 Sthollmark Rd., Warinchamrap, Ubonratchathani, 34190, Thailand) ,  Meewong Pijittra (Department of Chemistry, Faculty of Science, Ubon Ratchathani University, 85 Sthollmark Rd., Warinchamrap, Ubonratchathani, 34190, Thailand) ,  Pungpo Pornpan (Department of Chemistry, Faculty of Science, Ubon Ratchathani University, 85 Sthollmark Rd., Warinchamrap, Ubonratchathani, 34190, Thailand)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： ICAICTA  ページ： 1-6  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HIVに存在する逆転写酵素(RT)は,HIVを増加させるための重要な役割を果たしていると認識されている。RT活性の阻害は,HIVの増加を抑制することが期待される。多くの型ジアリールピリミジンの阻害剤RTとして合成した。それらの中で,TMC125およびTMC278はRT活性の阻害に重要な役割を果たすことが分かった。本研究では,配位子としていくつかのTMC278誘導体を取り上げ,RTの間の特異的相互作用と原子及び電子レベルで配位子を調べ,ab initioフラグメント分子軌道(FMO)計算を用いた。最初,誘導体は蛋白質-配位子ドッキングプログラムを用いたRTのリガンド結合ポケットにドッキングし,ドッキング構造を古典的分子力学法による水中の完全に最適化した。最後に,ab initio FMO計算を用いて,RTと誘導体の各アミノ酸残基の間の特異的相互作用は,電子レベルで明らかにした。FMO結果に基づいて,RTにいくつかの新しい阻害剤を提案し,それらの一つはRTに強く結合することを示した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *逆転写酵素 ,  アミノ酸残基 ,  相互作用 ,  ドッキング ,  分子軌道 ,  分子内力学 ,  タンパク質 ,  *HIV【ウイルス】 ,  最適化
準シソーラス用語： リガンド結合 ,  *分子シミュレーション ,  *フラグメント分子軌道法 ,  *阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  抗ウイルス薬の基礎研究  (GW17040O)

タイトルに関連する用語 (6件)： HIV ,  転写酵素 ,  阻害剤 ,  提案 ,  FMO法 ,  分子シミュレーション