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J-GLOBAL ID：201702265222322430   整理番号：17A0159906

トウモロコシ種子発育関連遺伝子遺伝子-RINのクローニング及び発現解析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Expression Analysis of ZmMADS-RIN Gene for Regulating the Kernel Development of Maize

著者 (8件)： Xia Xue (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science) ,  Ma Chenyu (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science) ,  Bai Qinghe (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science) ,  Feng Yuanyuan (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science) ,  Wang Shunyou (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science) ,  Wang Xi (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science) ,  Zhou Qingli (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science) ,  Xi Zhangying (College of Agronomy, Henan Agricultural University / State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Science)
資料名： Zuowu Xuebao  (Zuowu Xuebao)
巻： 42  号： 11  ページ： 1656-1665  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2128A  ISSN： 0496-3490  CODEN： TSHPA9  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： トウモロコシの穀粒の発育と収量はトウモロコシの重要な経済性状である。本研究では、トウモロコシ近交系「5858」を供試材料とし、同源法を用いて、トウモロコシの子実発育に関連する遺伝子ZMMADS-RINを得た。この遺伝子のCDNAの全長は859BPであり、オープンリーディングフレームは768BPであり、255個のアミノ酸をコードし、トウモロコシのB73に対応するCDNAのコード領域に比べ、6つのSNP部位の差異があり、3つのアミノ酸残基が変化した。バイオインフォマティクス解析により,ZMMADS-RIN蛋白質の相対分子量は29.23KDであり,理論的等電点は8.84であり,親水性蛋白質であり,シグナルペプチド配列も含まず,膜貫通構造も含まないことを示した。5つのリン酸化部位があった。二次構造には,%のΑ-ヘリックス(ALPHA HELIX),%のランダムコイル(RANDOM COIL),14.51の拡張(EXTENDED STRAND)と7.84のΒ-ターン(BETA TURN)が含まれている。この蛋白質は核内に位置している。そのアミノ酸配列には、高度に保存されたMADSドメイン、比較的保守的なKドメイン、比較的保守的なIドメインと最も不安定なCドメインがあり、典型的なMIKC型MADSボックスタンパク質である。系統樹解析の結果,ZMMADS-RIN蛋白質はAGL6に属し,イネ遺伝子遺伝子6との類似性は89%であった。ZMMADS-RIN遺伝子はトウモロコシトウモロコシ58の穀粒で特異的に発現し,根および異なる時期の葉で発現シグナルは検出されなかった。蛍光定量PCRの結果,ZMMADS-RIN遺伝子の発現量はトウモロコシの発育段階において一定の規則性を示し,受粉後0~20日では,あったの発現は増加し,受粉後25日では低レベルに減少した。受粉後30~40日では発現は検出されなかった。この遺伝子はトウモロコシの種子の発育に関与していると推測される。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 受粉 ,  等電点 ,  定量的PCR法 ,  親水性 ,  アミノ酸配列 ,  類似性 ,  シグナルペプチド ,  アミノ酸 ,  規則度 ,  分子量 ,  アミノ酸残基 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 系統解析 ,  バイオインフォマティクス ,  オープンリーディングフレーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Maize ,  Kernel development ,  ZmMADS-RIN ,  Gene cloning ,  RT-PCR

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素生理  (EH02020J)

タイトルに関連する用語 (6件)： トウモロコシ ,  種子 ,  発育 ,  遺伝子 ,  クローニング ,  発現解析