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J-GLOBAL ID：201702265365614711   整理番号：17A0062896

シンメンタールと脂肪酸含有量の低密度チップゲノム予測【JST・京大機械翻訳】

Genomic Prediction for Saturated Fatty Acid Content in Simmental using Low Density Chip

著者 (12件)： Qi Xin (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Jingjing (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Fan Huizhong (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Li Juan (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Hu Xin (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Fei (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhu Bo (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Gao Xue (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Chen Yan (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Lupei (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Gao Huijiang (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Li Junya (Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 47  号： 8  ページ： 1539-1545  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,低密度チップのスクリーニング法を探索し,低密度チップの精度を評価することである。本研究では、BOVINEHDの高密度チップを用いて、シンメンタールの塔Er牛基のSNP部位及びその脂肪酸と脂肪酸の含有量の関連性を測定し、P値又は効果値に基づき、低密度チップを構成し、IBSクラスタリングとランダムブロックを用いて交差検証を行った。遺伝子遺伝子を推定し、その正確性を評価する。結果により、14番染色体のMYC遺伝子の付近に5つの脂肪酸と脂肪酸の性状が著しい相関があり、シンメンタールの脂肪酸含有量の候補遺伝子として後続の研究を行うことができることが分かった。P値によって標識を選択し、IBSクラスタリングを用いて交差検証を行う場合、遺伝子遺伝子の正確性が最も高く、チップ密度が7Kに達した時、正確性が安定していると推定される。そのため、本研究で発見したマーカー遺伝子座はシンメンタールの脂肪酸含有量に一定の影響があり、低密度チップのマーカー遺伝子座の選別に参考資料を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *脂肪酸 ,  参考図書 ,  エルビウム ,  染色体 ,  スクリーニング ,  クラスタ化
準シソーラス用語： マーカー遺伝子 ,  候補遺伝子 ,  正確性 ,  高密度 ,  *低密度 ,  *シンメンタール , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： GWAS ,  genomic selection ,  low density chip ,  SNP ,  Simmental

分類 (4件)： 牛  (FD02020Y) ,  生肉の品質と処理  (FJ12032O) ,  飼育動物の育種  (FD01020R) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： シンメンタール ,  脂肪酸 ,  含有量 ,  低密度 ,  ゲノム ,  予測