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J-GLOBAL ID：201702266160549590   整理番号：17A0202358

本研究では,菌蛋白質のプロテオミクス研究における次元-質量複合体の応用を研究した。【JST・京大機械翻訳】

Use of multidimensional liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry in Shigella proteomics

著者 (8件)： Zhao Lina (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology) ,  Tang Hongmei (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology) ,  Hu Fen (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology) ,  He Baoling (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology) ,  Li Weiwei (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology) ,  Yu Yuan (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology) ,  Liu Yan (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology) ,  Wang Yang (College of Life Sciences, North China University of Science and Technology)
資料名： Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi  (Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi)
巻： 11  号： 8  ページ： 696-700  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3057A  ISSN： 1673-5234  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】多次元液体クロマトグラフィー-質量分析システムを確立して,フレキシナのより完全な蛋白質の情報を得る。【方法】フレキシナ2Aの誌301株(SF2A301)の全蛋白質を分離し,蛋白質と膜蛋白質を分離した。二次元液体クロマトグラフィーマトリックス支援レーザ脱離/飛行時間型タンデム質量分析(2D LC-MALDI-TOF/TOF)と二次元液体クロマトグラフィータンデム質量分析(2D LC-ESI-MS/MS)によって構成された次元 MMI.D 質量の蛋白質分離と同定を行った。MASCOTとSEQUESTソフトウェアを用いて、NCBI上のSF2A301のタンパク質データベースを検索し、二種類のタンデム質量分析の相補性と組み合わせ後の優勢を分析した。【結果】MALDI-TOF/TOFおよびESI-MS/MSにより,それぞれ,960の蛋白質および729の蛋白質を同定し,合計1の蛋白質を同定した。2つの技術的方法によって同定された蛋白質の平均アミノ酸配列の範囲は,それぞれ14.3%と13.9%であり,組合せ同定の後の被覆率は15.7%に増加した。MALDIとESIの両方のイオン化モードは相補性があり、MALDIはイオン化分子の質量が小さく、アルカリ性、トリプシンの消化後のカルボキシル末端がアルギニンのペプチドであることを示した。ESIはイオン化分子量が大きく,疎水性,トリプシン消化後にカルボキシル末端がリジンのペプチドになる傾向がある。結論:2D LC-MALDI-TOF/TOFと2D LC-ESI-MS/MSを用いてSF2A301の全蛋白質群を同定し、相互に確認した。蛋白質同定の信頼性と信頼性の両方において,次元-MMI.D複合体は,単一タンデム質量分析法よりも優れており,複雑なサンプルのプロテオミクス研究プラットフォームとして用いることができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 疎水性 ,  アミノ酸配列 ,  LC-MS分析 ,  トリプシン ,  データベース ,  *タンパク質 ,  消化 ,  相補性 ,  タンデム質量分析 ,  *プロテオミクス ,  分子量 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： C末端 ,  ESI-MS/MS ,  二次元液体クロマトグラフィー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Shigella flexneri ,  MALDI ,  ESI ,  proteomics

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： アルギニン

タイトルに関連する用語 (8件)： 研究 ,  菌 ,  蛋白質 ,  プロテオミクス ,  次元 ,  質量 ,  複合体 ,  応用