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J-GLOBAL ID：201702267010327236   整理番号：17A0346882

ブタ流行性下痢ウイルス変異株,古典的毒株及び弱毒疫苗株/RT多重RT-PCR同定法の確立及び応用【JST・京大機械翻訳】

Development and Application of Multiplex RT-PCR Method for Differentiation of Variant,Classical and Attenuated Vaccine Strains of Porcine Epidemic Diarrhea Viruses

著者 (11件)： Qin Yibin (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Lu Bingxia (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Duan Qunpeng (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  He Ying (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Li Bin (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Liang Jiaxing (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Su Qianlian (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Zhou Yingning (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Jiang Dongfu (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Lu Jingzhuan (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology) ,  Zhao Wu (Guangxi Veterinary Research Institute,Guangxi Key Laboratory of Animal Vaccines and New Technology)
資料名： Xinan Nongye Xuebao  (Xinan Nongye Xuebao)
巻： 29  号： 11  ページ： 2746-2751  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3020A  ISSN： 1001-4829  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ブタの流行性下痢ウイルス(PEDV)変異株,古典的毒株及び弱毒疫苗株の迅速同定法を確立するために,GENBANKに公表されたPEDV変異株,古典的株及びと株のS遺伝子及びORF3遺伝子に基づいて,2対の特異的プライマーを設計し,合成した。PEDV S遺伝子とORF3遺伝子を増幅し、目的断片の数量と断片サイズにより、PEDVの毒株のタイプを判断する。アニーリング温度などの反応条件を最適化することによって,多重RT-PCR法を,異なるPEDV株の検出のために確立した。結果により、確立した多重RT-PCR同定方法は、PEDV変異株、古典株と受けた株を特異的に区別することができることが分かった。PEDVの突然変異体は2つのバンドを含み,それぞれ234BPのORF3遺伝子と826BPのS遺伝子フラグメントを含んでいた。PEDVの古典的毒株拡増は,234BPのORF3遺伝子フラグメントを含む1つの標的フラグメントを示した。一方,弱毒ワクチンは1つの標的フラグメントを含み,185BPのORF3遺伝子フラグメントを増幅した。ブタ伝染性胃腸炎ウイルス、A群ロタウイルス、,ウイルス、ブタ繁殖と呼吸症候群ウイルス、豚偽狂犬病ウイルス、豚コレラウイルス、ブタサーコウイルスウイルス、ブタ細環ウイルス、ブタパルボウイルスウイルス、ブタウイルスはいずれも交差反応がない。感受性試験は,検出限界が2.3×10-4NG/ΜLであることを示した。この方法は良好な再現性を示した。この方法を用いて,広西チワン族自治区のいくつかの地域における91の臨床下痢サンプルを検出し,その中で,PEDV%(57/64)の突然変異株が4.69%(3/64)を占めた。弱毒ワクチン株は6.25%(4/64)であった。結果により、この多重RT-PCR鑑別方法は特異性が高く、感度が高く、操作が簡単で、ブタ流行性下痢の疫学及び病原の鑑別診断研究に参考となる技術手段を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 鑑別診断 ,  感受性試験 ,  *ウイルス ,  鑑別 ,  *RT-PCR法 ,  検出限界 ,  最適化 ,  再現性 ,  遺伝子 ,  疫学 ,  *下痢
準シソーラス用語： 特異性 ,  A群ロタウイルス ,  弱毒ワクチン ,  S遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： PEDV ,  Variant strain ,  Classical strain ,  Attenuated vaccine strain ,  RT-PCR ,  Differential diagnosis

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (8件)： ブタ流行性下痢ウイルス ,  変異株 ,  毒 ,  株 ,  RT ,  多重 ,  同定法 ,  応用