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J-GLOBAL ID：201702272588619680   整理番号：17A0707173

コムギと条Xiu菌親との相互作用のための差ライブラリーの構築と予備分析を行った。【JST・京大機械翻訳】

Construction and Preliminary Analysis of the Compatible SSH cDNA Library Between Puccinia striiformis and Wheat

著者 (8件)： YU Xiudao (College of Plant Protection, Northwest A & F University) ,  QU Zhipeng (College of Plant Protection, Northwest A & F University) ,  GUO Jun (College of Plant Protection, Northwest A & F University) ,  YU Xiumei (Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture, Northwest A&F University) ,  HUANG Xueling (College of Plant Protection, Northwest A & F University) ,  HAN Qingmei (Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture, Northwest A&F University) ,  HUANG Lili (College of Plant Protection, Northwest A & F University) ,  KANG Zhensheng (College of Plant Protection, Northwest A & F University)
資料名： Zhongguo Nongye Kexue  (Zhongguo Nongye Kexue)
巻： 41  号： 5  ページ： 1267-1273  発行年： 2008年05月10日 
JST資料番号： W1459A  ISSN： 0578-1752  CODEN： CKNYAR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】コムギとコムギの間の相互作用のための差ライブラリーを構築し,コムギの感染過程における差次的発現遺伝子を分離した。[方法]コムギ品種品種11と黄さび病の相応する毒性のあるCY31号を材料とし、黄さび病感染段階のSSH-CDNAライブラリーを構築し、250個の陽性クローンを選別し、生物情報学分析を行った。【結果】149の非冗長EST(BLASTX)をクラスタ化した。BLASTXの比較と機能分類分析により、そのうち50本のBLASTX(33.6%)は相同性整合を認めず、25本(16.8%)は未知の機能タンパク質との相同性が高いことが分かった。その他の74の機能が知られているBLASTXにおいて、一次代謝、エネルギーに関連する遺伝子はそれぞれ13本と10個であり、8.7%と6.7%を占め、感受性と防御に関連する遺伝子は6個が約4.0%を占める。また,2つの病原菌と高い相同性を持つ遺伝子が得られた。次に,RT-PCRを用いて,6つの遺伝子の発現パターンを分析した。【結語】コムギととの相互作用のための差ライブラリーを首尾よく構築し,コムギ黄さび病の病原性に関連する遺伝子を分離し,黄さび病の感染過程における特異的遺伝子の機能を研究するために使用することができた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ化 ,  遺伝子 ,  感受性 ,  *コムギ ,  病原性 ,  相同性 ,  クローン ,  *相互作用 ,  タンパク質 ,  品種 ,  RT-PCR法 ,  感染
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  黄さび病 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Triticum aestivum ,  Puccinia striiformis ,  Suppression subtractive hybridization (SSH) ,  Compatible interaction ,  Reverse transcription PCR (RT-PCR)

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： コムギ ,  菌 ,  親 ,  相互作用 ,  ライブラリー ,  構築 ,  分析