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J-GLOBAL ID：201702274375492057   整理番号：17A0107023

全ゲノム範囲におけるイネ科植物GPX遺伝子ファミリーの進化解析と発現パターン研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide evolutionary analysis and expression of glutathione peroxidase genes in Gramineae

著者 (3件)： Yang Xue (College of Life Sciences, Jilin Agricultural University) ,  Liu Cuijing (College of Chinese Medicinal Materials, Jilin Agricultural University) ,  Yang Meiying (College of Life Sciences, Jilin Agricultural University)
資料名： Xibei Nonglin Keji Daxue Xuebao(Zirankexueban)  (Xibei Nonglin Keji Daxue Xuebao(Zirankexueban))
巻： 44  号： 10  ページ： 176-183,192  発行年： 2016年 
JST資料番号： C5021A  ISSN： 1671-9387  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]本研究の目的は,イネ科植物におけるグルタチオンペルオキシダーゼ(GPX)遺伝子ファミリーの配列と,正常な成長とストレス条件下での発現の違いを研究し,植物のストレス耐性におけるGPX遺伝子の役割を明らかにするための基礎を築くことである。[方法]バイオインフォマティクス法を用いて、水稲、カモジグサ、モロコシの18個のGPX遺伝子の配列特徴、遺伝子構造と系統進化関係を分析した。逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)を用いて,18のGPX遺伝子を正常成長,1-クロロ-2,4-ジニトロベンゼン(CDNB),過酸化水素(H_2O_2),アトラジン(アトラジン)およびサリチル酸(SA)によって処理した。イネ,カモジグサ,モロコシの根,茎,成熟葉,若葉,葉鞘,および正常な成長条件下で発芽した2日後の根の芽と芽の発現を観察した。【結果】6,5,7つのGPX遺伝子を,イネ,,,およびモロコシのゲノムから同定し,これらの遺伝子の長さは,168~251アミノ酸の蛋白質であり,分子量は18.44~27.42KUであった。系統発生分析により、3つの種は少なくとも7つの最近の共通の祖先遺伝子があり、種分化後、水稲とカモジグサはそれぞれ1つと2つのGPX遺伝子を失うことが分かった。配列類似性分析により、3つの種のGPXタンパク質は高い配列類似性を持ち、38.0%~95.2%を占め、しかも異なる遺伝子クラスターにおけるGPX配列の分化率が異なることが分かった。3つの種のGPX遺伝子は保存された遺伝子構造を持っているが、SBGPX7はイントロン挿入事件を発生し、その他のGPX遺伝子との機能の分化を示唆している。発現パターン分析により,3つの種の18のGPX遺伝子のうち15はすべての検出サンプルで構成的に発現し,3つのGPX遺伝子(イネ2つ,モロコシ1つ)は選択的に発現し,発現パターンの分化は機能の分化を示唆した。[結論]植物保護細胞は酸化損傷の重要な酵素類として、イネ科の3つの種のGPX遺伝子は進化過程で機能分化を発生した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 過酸化水素 ,  分化 ,  分子量 ,  系統発生 ,  類似性 ,  水稲 ,  *ゲノム ,  RT-PCR法 ,  *遺伝子 ,  モロコシ
準シソーラス用語： 系統解析 ,  遺伝子構造 ,  バイオインフォマティクス ,  *遺伝子ファミリー ,  *遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： glutathione peroxidase ,  Gramineae ,  gene evolutionary analysis ,  gene expression pattern

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (8件)： ゲノム ,  イネ科植物 ,  GPx ,  遺伝子ファミリー ,  進化 ,  解析 ,  発現パターン ,  研究