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J-GLOBAL ID：201702275703744778   整理番号：17A0388407

トポロジー的に正確な生存転帰予測のための経路活性を推定する:1例としての乳癌【Powered by NICT】

Topologically inferring pathway activity for precise survival outcome prediction: breast cancer as a case

著者 (9件)： Liu Wei (The Key Laboratory of Molecular Biology for High Cancer Incidence Coastal Chaoshan Area, Shantou University Medical College, Shantou, 515041, China. [e-mail] [e-mail]) ,  Wang Wei ,  Tian Guohua ,  Xie Wenming ,  Lei Li ,  Liu Jiujin ,  Huang Wanxun ,  Xu Liyan ,  Li Enmin
資料名： Molecular BioSystems  (Molecular BioSystems)
巻： 13  号： 3  ページ： 537-548  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 1742-206X  CODEN： MBOIBW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 患者の生存転帰を予測する正確に臨床癌研究において非常に重要である。過去10年間に,遺伝子発現データに基づく建物生存予測モデルは,益々関心を集めている。しかし,既存の方法は,主に個々の遺伝子の特徴,独立データセットと不明の生物学的関連性に限られた予測精度を有することが知られている,に基づいている。,生存転帰を正確に予測するために著者らはDRWPSurvと呼ばれる新しい経路に基づく生存予測法を提案した。DRWPSurvは生存関連経路活性を推定トポロジーへの遺伝子発現プロファイルと前遺伝子相互作用情報を統合し,Lasso Coxモデルを構築するための特徴として経路活性を用いた。有向ランダムウォークによる評価遺伝子の位相的重要性を簡潔に用いる経路活性のロバスト性を強化し,それにより予測性能を改善した。は三つの独立した乳癌データセット上でDRWPSurvを適用し,従来の遺伝子に基づく方法と四経路に基づく方法を用いた予測性能を比較した。結果は,経路に基づく方法は遺伝子に基づく方法と同等か優れた予測性能を得たが,DRWPSurvは経路に基づく方法の中で良好な精度とロバスト性と生存転帰を予測できることを示した。さらに,DRWPSurvにより同定されたリスク経路は乳癌の予後と治療のための生物学的に有益なモデルを提供する。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 酔歩 ,  予測技法 ,  *乳房腫瘍 ,  位相 ,  予測モデル ,  患者 ,  ロバスト性 ,  遺伝子 ,  *位相幾何学
準シソーラス用語： 予測性能 ,  遺伝子相互作用 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  予測精度 ,  遺伝子発現データ ,  *転帰 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (8件)： トポロジー ,  生存 ,  転帰 ,  予測 ,  経路 ,  活性 ,  推定 ,  乳癌