文献

J-GLOBAL ID：201702276731267203   整理番号：17A0300843

貝類全ゲノムワイドの育種評価と分析システムの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of the Genomic Analysis and Evaluation System for Shellfish Genetic Breeding

著者 (5件)： Su Hailin (College of Marine Life Sciences,Ocean University of China) ,  Wang Yangfan (College of Marine Life Sciences,Ocean University of China) ,  Hu Xiaoli (College of Marine Life Sciences,Ocean University of China) ,  Wang Shi (College of Marine Life Sciences,Ocean University of China) ,  Bao Zhenmin (College of Marine Life Sciences,Ocean University of China)
資料名： Zhongguo Haiyang Daxue Xuebao. Zirankexueban  (Zhongguo Haiyang Daxue Xuebao. Zirankexueban)
巻： 46  号： 10  ページ： 65-72  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2597A  ISSN： 1672-5174  CODEN： ZHDXB3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 貝類の育種において、応用の正確率が従来の系統データの最適線形偏差推定方法より高いため、全ゲノム選択アルゴリズムのMIXPソフトウェアをコアとし、国内貝類育種プロジェクトの研究と結合した。本研究では,ウェブサイトのサービス形式に基づくゲノム選択ネットワーク育種プラットフォームを設計し,開発した。このシステムは,UBUNTU LINUX環境においてMYSQLデータベースとJAVAプログラミング言語に基づくサーバーの動的WEBページ(JAVA SERVER PAGES,JSP)の技術開発を完成した。このシステムは,システムの公告,総合的質問,情報維持,タスク管理,育種評価,および選好選択を含む6つの機能モジュールを含み,データシミュレーション,形質測定記録の貯蔵と質問,遺伝的パラメータ推定,分子マーカー効果推定を実行する。また、選別方法のカスタム化などの主要な仕事についても述べた。2つの親と96の子孫の殻長データと遺伝子型情報を含む98の を,実現可能性試験において分析した。全ゲノムに分布する単一一本鎖多型(SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM,SNP)分子マーカー効果および個体の推定育種価を算出し,推定値と表現型値との相関係数は0.703であった。これらの結果はシステムが正常に動作することを示した。このシステムの貝類育種における普及と応用は、業界の全体技術レベルを有効に向上させ、中国貝類育種の発展を推進することができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  推定量 ,  遺伝子型 ,  Java ,  線形性 ,  表現型 ,  *ゲノム ,  相関係数 ,  カスタム化 ,  *育種 ,  育種価
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  遺伝的パラメータ ,  Webサイト ,  ゲノム選択 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： shellfish breeding ,  genome-wide select ,  breeding system based on internet

分類 (3件)： CAI  (JE09000G) ,  計算機システム開発  (JD02010R) ,  汎用プログラミング言語  (JD03051H)

タイトルに関連する用語 (6件)： 貝類 ,  ゲノム ,  育種 ,  評価 ,  分析 ,  開発