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J-GLOBAL ID：201702279898356577   整理番号：17A0079244

ワタは長鎖非コードRNAの同定と機能予測を発達させた。【JST・京大機械翻訳】

Long Non-Coding RNAs and Their Predicted Functions in Shoot Apex Development of Cotton (Gossypium hirsutum L.)

著者 (7件)： Wang Furong (Shandong Provincial Key Laboratory of Plant Stress Research / College of Life Sciences, Shandong Normal University, Key Laboratory of Cotton Breeding and Cultivation in Huang-Huai-Hai Plain, Ministry of Agriculture) ,  Qiao Qinghua (Shandong Provincial Key Laboratory of Plant Stress Research / College of Life Sciences, Shandong Normal University, Key Laboratory of Cotton Breeding and Cultivation in Huang-Huai-Hai Plain, Ministry of Agriculture) ,  Chen Pengyun (Key Laboratory of Cotton Breeding and Cultivation in Huang-Huai-Hai Plain, Ministry of Agriculture / Cotton Research Center of Shandong Academy of Agricultural Sciences) ,  Yuan Zhecheng (Shandong Provincial Key Laboratory of Plant Stress Research / College of Life Sciences, Shandong Normal University, Key Laboratory of Cotton Breeding and Cultivation in Huang-Huai-Hai Plain, Ministry of Agriculture) ,  Chen Yu (Key Laboratory of Cotton Breeding and Cultivation in Huang-Huai-Hai Plain, Ministry of Agriculture / Cotton Research Center of Shandong Academy of Agricultural Sciences) ,  Fan Shoujin (山東師范大学生命科学学院) ,  Zhang Jun (Shandong Provincial Key Laboratory of Plant Stress Research / College of Life Sciences, Shandong Normal University, Key Laboratory of Cotton Breeding and Cultivation in Huang-Huai-Hai Plain, Ministry of Agriculture)
資料名： Mianhua Xuebao  (Mianhua Xuebao)
巻： 28  号： 5  ページ： 470-477  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2409A  ISSN： 1002-7807  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 長鎖非コードRNA(LONG NON-CODING RNA,LNCRNA)は長さが200NT以上の非コードRNAである。それは蛋白質コード化機能を持たないが,生体内ではRNA分子の形で多くの生物過程に関与している。実験室で得られた陸地のトランスクリプトームデータを用いて、8044本のLNCRNAを同定し、そのうち3691本はAT亜群に分布し、2852本はDT亜群に分布した。遺伝子共の位置決め、塩基相補性のマッチングなどの生物情報学方法により、そのうち中個のLNCRNAに対して機能的アノテーションを行い、そのうち1875個はコード遺伝子の上流に位置し、コード遺伝子のシス作用要素あるいは3’UTR領域と結合する可能性がある。転写または転写後に遺伝子発現を制御する。317個のアンチセンスLNCRNAとセンスのMRNAは相互作用し、塩基相補性により遺伝子サイレンシング、転写及びMRNAの安定性を調節する。20のLNCRNAはMICRORNAの前駆体として予測された。5本のLNCRNAは4つのLNCRNAファミリーにアノテーションされた。機能的アノテーションにより、これらのLNCRNAは主に転写調節、代謝、ホルモン応答及びシグナル伝達などの生物過程に参与することが明らかになった。本研究はハイスループット配列データを利用して綿花のLNCRNAを研究するために新しい構想を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子発現 ,  *RNA【核酸】 ,  陸地 ,  ホルモン ,  アノテーション ,  遺伝子サイレンシング ,  遺伝子 ,  符号化 ,  相補性 ,  *長鎖
準シソーラス用語： ハイスループット ,  転写調節 ,  シスエレメント ,  バイオインフォマティクス ,  *非翻訳RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： cotton ,  shoot apical RNA-seq data ,  long non-coding RNA ,  identification ,  functional prediction

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： ワタ ,  長鎖非コードRNA ,  同定 ,  予測 ,  発達