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J-GLOBAL ID：201702281088402591   整理番号：17A0163480

トランスクリプトーム学測序に基づくLARIX の遺伝子発現遺伝子【JST・京大機械翻訳】

Gene Expression of Wood Properties Based on Transcriptome of Larix olgensis

著者 (5件)： Zhao Jiali (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Northeast Forestry University) ,  Zhang Lei (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Northeast Forestry University) ,  Zhang Sufang (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Northeast Forestry University) ,  Wang Yanhong (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Northeast Forestry University) ,  Zhang Hanguo (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Northeast Forestry University)
資料名： Dongbei Linye Daxue Xuebao  (Dongbei Linye Daxue Xuebao)
巻： 44  号： 4  ページ： 8-12  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2441A  ISSN： 1000-5382  CODEN： DLDXEU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 辺(BY BY SYNTHESIS,SBS)技術に基づき,ILLUMINA HISEQ2500のハイスループット配列決定プラットフォームを用いて, のCDNAライブラリーを配列決定した。全部で非BPの非反復配列が得られ,全長は55BPであった。得られた転写産物をBLASTソフトウェアを用いて非反復配列の遺伝子配列をNR、SWISS-PROT、GO、COG、KEGGデータベースと比較し、BLASTのパラメータを選択することにより、10-5を超えないことが分かった。最終的に29個のアノテーション情報を持つ遺伝子配列が得られ,その中で19個の転写本アノテーションGO番号は,9個の転写が本データベースにおいて25個の機能分類に分けられ,同時に120個のKEGG代謝経路にアノテーションされた。その結果,リグニン関連遺伝子の合計68の遺伝子が得られ,リグニンの合成に関連する遺伝子は29のリグニンと関連し,リグニンの代謝に関連した遺伝子は27の遺伝子を含んでいることが分かった。147のセルロース関連遺伝子を発見し,その中にセルロース合成関連遺伝子103本,セルロース分解代謝関連遺伝子44本を同定した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： リグニン ,  ソフトウェア ,  アノテーション ,  *遺伝子 ,  代謝 ,  代謝経路 ,  *トランスクリプトーム ,  データベース ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： KEGG ,  遺伝子配列 ,  BLAST ,  転写産物 ,  ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Larix olgensis ,  Transcriptome ,  High throughput sequencing ,  Wood properties

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトーム ,  Larix ,  遺伝子発現 ,  遺伝子