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J-GLOBAL ID：201702283388310521   整理番号：17A0214005

NGS(次世代シーケンシング)データのための論理条件の組合せのためのウェブベースのパイプラインツール【Powered by NICT】

A Web Based Pipeline Tool for the Combination of Logic Conditions for NGS Data

著者 (2件)： Li Hui ,  Liu Chunmei
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： ICMLA  ページ： 498-501  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 次世代シークエンシング(NGS)データを解析するためのソフトウェアツールの開発はバイオインフォマティクス分野における緊急タスクの一つである。現在,ロット次世代シーケンシングデータ解析ソフトウェアを開発した。しかし,それらの大部分は,コマンド株による配列アラインメントまたは機能アノテーションのような分析の一つのタイプをサポートするのみである。,より少ない配置とNGSデータの優しいユーザインタフェイスが必要である。本論文では,高性能計算環境上で動作するウェブベース自動パイプラインを紹介した。生データはイルミネ配列決定装置から発生した。GATK基づく並列整流方式を用いて,結果を制御し,発生させた。パイプラインはfastQファイルグラフィカルインターフェイスによるアップロードから始まる。データを自動的に解析した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： ユーザインタフェイス ,  *支援プログラム ,  アノテーション
準シソーラス用語： アップロード ,  高性能コンピューティング ,  配列アライメント ,  バイオインフォマティクス ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 人間機械系  (IB03000G)

タイトルに関連する用語 (6件)： 次世代シーケンシング ,  論理 ,  組合せ ,  ウェブ ,  パイプライン ,  ツール