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J-GLOBAL ID：201702283472181930   整理番号：17A0205895

大腸菌の可溶性高効率発現は,直列ハイブリッドユビキチン結合ドメイン蛋白質(THUBD)の発現によるものであった。【JST・京大機械翻訳】

Soluble expression of tandem hybrid ubiquitin-binding domains (ThUBD) in prokaryotic cytoplasm of Escherichia coli BL21(DE3)

著者 (5件)： Luo Weijia (Anhui Medical University, State Key Laboratory of Proteomics) ,  Deng Chen (State Key Laboratory of Proteomics,Beijing Proteome Research Center,National Engineering Research Center for Protein Drugs,National Center for Protein Sciences,Beijing Institute of Radiation Medicine) ,  Li Yanchang (State Key Laboratory of Proteomics,Beijing Proteome Research Center,National Engineering Research Center for Protein Drugs,National Center for Protein Sciences,Beijing Institute of Radiation Medicine) ,  Gao Yuan (State Key Laboratory of Proteomics,Beijing Proteome Research Center,National Engineering Research Center for Protein Drugs,National Center for Protein Sciences,Beijing Institute of Radiation Medicine) ,  Xu Ping (Anhui Medical University, State Key Laboratory of Proteomics)
資料名： Junshi Yixue  (Junshi Yixue)
巻： 40  号： 10  ページ： 795-800,818  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2949A  ISSN： 1674-9960  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】大腸菌における人工 HYBRID UBD(THUBD)の可溶性発現を向上させ,ユビキチン化蛋白質の研究のための効率的特異的濃縮法を提供する。【方法】大腸菌のコドンを,大腸菌の同義コドン相対頻度(RFSC)に従って分類し,THUBDコドンの相対的適応度を計算し,分析結果に従ってTHUBDのコドンを最適化した。誘導発現と蛋白質の定量的コドンの最適化結果を得た。親和性精製およびユビキチン化蛋白質濃縮研究は,コドン最適化後のTHUBD-S-UBC結合能を検出した。結果:分析結果に基づき、THUBDコドンを最適化し、大腸菌の遺伝子発現に適したコドンを48%から75%に増加させ、転写翻訳を阻害するコドンを除去し、そのコドンの子適応指数(CAI)は0.63から0.88に上昇した。コドン最適化後の可溶性蛋白質THUBD-Sの発現量は4倍増加し,総蛋白質の%%に達した。同時に,最適化されたTHUBD-Sはより高いUBCの結合能を有している可能性がある。結論:THUBDの遺伝子配列を最適化した後、大腸菌における発現量は4倍ほど上昇した。同時に、配列最適化は融合タンパク質THUBDの大腸菌における可溶性発現と結合の結合能力に影響しない。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 最適化 ,  *可溶性 ,  融合タンパク質 ,  コドン ,  親和性 ,  *結合部位 ,  *大腸菌 ,  *タンパク質 ,  *溶解性
準シソーラス用語： 遺伝子配列 ,  可溶性蛋白質 ,  コドン最適化 ,  誘導発現 ,  適応度 ,  ユビキチン化蛋白質 ,  高効率 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ThUBD ,  ubiquitin conjugates (UbC) ,  Escherichia coli ,  codon optimization ,  recombinant expression ,  proteomics

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 大腸菌 ,  可溶性 ,  高効率 ,  発現 ,  直列 ,  ユビキチン ,  結合ドメイン ,  蛋白質