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J-GLOBAL ID：201702284863525390   整理番号：17A0202333

中国におけるヒトフィンガリング感染のハイスループット配列解析【JST・京大機械翻訳】

Characterization of anelloviruses in the Chinese population using high-throughput sequencing

著者 (9件)： Cheng Shi (Anhui Medical University; State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity) ,  Fan Hang (State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology) ,  Sun Qiang (State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology) ,  Pei Guangqian (State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology) ,  An Xiaoping (State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology) ,  Mi Zhiqiang (State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology) ,  Zhang Xianglilan (State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology) ,  Huang Yong (State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology) ,  Tong Yigang (Anhui Medical University; State Key Laboratory of Pathogens and Biosecurity)
資料名： Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi  (Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi)
巻： 11  号： 10  ページ： 865-870  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3057A  ISSN： 1673-5234  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】中国人における感染感染症の多様性を分析することによって,フィンガリング科の感染と疾患の発生と宿主免疫状態の間の関係を研究するための基礎データを提供する。方法:33個の血液サンプルからウイルス核酸を抽出し、多重置換増幅技術を用いてフィンガリングウイルス核酸を濃縮し、その後、ION TORRENT PGMプラットフォームを用いてハイスループットシークエンシングを行い、生物情報学的分析を行った。【結果】226の新規フィンガリング配列が得られ,それは130の全配列と96のORF1を含んでいた。血液サンプルには,TTV,,,TTMVなどのフィンガリングウイルスが検出された。配列分析により、フィンガリングウイルスの81.9%がTTVであり、48.5%の標本が2つ以上のフィンガリングウイルスに感染していることが示された。フィンガリングウイルスのORF1は少なくとも81.13に変異し,そのうちTTV属内にも%の変異が存在し,13.27の配列はNCBIの核酸データベースにおける相同性は成功していない。進化分析によりTTV遺伝子3型は3.1,3.2,3.3の3つの亜型に分けられ,以前に命名された遺伝子型2は遺伝子3.3型の一つの分枝であることが示された。新しいタイプのTTVは,遺伝子型3に属している。結論:中国の人々は一般的にフィンガリングウイルスを感染し、遺伝子3型の感染が多く、しかもゲノムの多様性が高い。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  核酸 ,  *中華人民共和国 ,  相同性 ,  *感染 ,  遺伝子 ,  ウイルス
準シソーラス用語： 遺伝多様性 ,  核酸データベース ,  NCBI ,  バイオインフォマティクス ,  多重置換増幅 ,  中国人 ,  *配列解析 ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Anellovirus ,  multiple displacement amplification (MDA) ,  Torque teno virus (TTV) ,  phylogenetic analysis

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (6件)： 中国 ,  ヒト ,  フィンガリング ,  感染 ,  ハイスループット ,  配列解析