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J-GLOBAL ID：201702287594959750   整理番号：17A0521728

プロモーター:プロモーターの型は集団によって多様であり,プロモーターの進化や発現ノイズに影響を及ぼす

Promoter shape varies across populations and affects promoter evolution and expression noise

著者 (11件)： SCHOR Ignacio E (European Molecular Biology Lab. (EMBL), Heidelberg, DEU) ,  DEGNER Jacob F (European Molecular Biology Lab. (EMBL), Heidelberg, DEU) ,  HARNETT Dermot (European Molecular Biology Lab. (EMBL), Heidelberg, DEU) ,  CANNAVO Enrico (European Molecular Biology Lab. (EMBL), Heidelberg, DEU) ,  GARFIELD David A (European Molecular Biology Lab. (EMBL), Heidelberg, DEU) ,  FURLONG Eileen E M (European Molecular Biology Lab. (EMBL), Heidelberg, DEU) ,  CASALE Francesco P (European Bioinformatics Inst. (EBI), Hinxton, GBR) ,  BIRNEY Ewan (European Bioinformatics Inst. (EBI), Hinxton, GBR) ,  STEGLE Oliver (European Bioinformatics Inst. (EBI), Hinxton, GBR) ,  SHIM Heejung (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  STEPHENS Matthew (Univ. Chicago, Illinois, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 49  号： 4  ページ： 550-558  発行年： 2017年04月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 動物のプロモーターは,正確な地点からか(絞り込み型プロモーター),あるいは分散した領域からか(広範囲型プロモーター),そのどちらかから転写を開始するので,この型の違いによりプロモーターを区別できる。プロモーターは高度に保存されているが,型によるプロモーターの機能の違いや,それぞれが進化してきた過程の遺伝学的基盤は解明されていない。本論文では,ショウジョウバエ(Drosophila)の天然の遺伝的バリエーションである81系統の集団において,転写開始部位(TSS)の利用の違いを測定し,転写産物レベル(強度)あるいはプロモーター内のTSSの分布(型)に影響を及ぼす何千もの遺伝学的バリアントを明らかにした。我々の結果から,プロモーターの型はプロモーター強度とは独立に進化できる分子的形質であることが分かった。広範囲型プロモーターは典型的には,型に関連するバリアントを含み,適応選択のシグネチャーを示す。単一細胞での測定から,プロモーターの型を変化させるバリアントは発現ノイズを増加させることが多いが,他のプロモーターバリアントとのヘテロ対立遺伝子性相互作用がこれらの効果を減弱することが示された。これらの結果から,天然のプロモーターの新しい機能特性が明らかになり,また,発現ノイズを最小にすることがプロモーター進化の重要な要因であると考えられた。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： ショウジョウバエ ,  *量的形質遺伝子座 ,  *プロモーター領域 ,  *ヌクレオチド ,  RNA【核酸】 ,  突然変異体 ,  対立遺伝子 ,  *遺伝子発現 ,  機能 ,  分子進化 ,  ゲノム ,  遺伝子ライブラリー ,  型 ,  相互作用 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： QTL【遺伝】 ,  *コアプロモーター ,  *転写開始部位 ,  転写産物 ,  遺伝的変異体 ,  CAGE法

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： プロモーター ,  型 ,  集団 ,  進化 ,  発現 ,  ノイズ