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J-GLOBAL ID：201702289420106596   整理番号：17A0160331

遺伝子の特異反復配列の分離と応用【JST・京大機械翻訳】

Isolation of Thinopyrum ponticum Genome Specific Repetitive Sequences and Their Application for Effective Detection of Alien Segments in Wheat

著者 (8件)： Yao Han (College of Agriculture, Nanjing Agricultural University) ,  Tang Caiguo (College of Agriculture, Nanjing Agricultural University) ,  Zhao Jing (College of Agriculture, Nanjing Agricultural University) ,  Zheng Qi (Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences/State Key Laboratory of Plant Cell and Chromosome Engineering) ,  Li Bin (Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences/State Key Laboratory of Plant Cell and Chromosome Engineering) ,  Hao Chenyang (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Li Zhensheng (Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences/State Key Laboratory of Plant Cell and Chromosome Engineering) ,  Zhang Xueyong (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Zhongguo Nongye Kexue  (Zhongguo Nongye Kexue)
巻： 49  号： 19  ページ： 3683-3693  発行年： 2016年 
JST資料番号： W1459A  ISSN： 0578-1752  CODEN： CKNYAR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的] (構築)はコムギ(TRITICUM AESTIVUM L.)の多年生野生植物であり、小麦品種改良のための多くの優れた遺伝子を持っている。遺伝子の特異反復配列を用いて、種の進化関係を研究し、染色体のフィンガープリントを作成し、外来性染色体を検出することができる。10倍長のELONGATU(HOST PONTICUM (HOST)LIU AND WANG)遺伝子遺伝子反復配列をクローニングし,コムギの背景に導入された 遺伝子の同定と追跡に用いることができた。【方法】10倍の長さのELONGATU CDNAライブラリーを構築し,高密度点交雑(DOT-BLOT)によりスクリーニングした。蛍光IN SITUハイブリダイゼーション(FLUORESCENCE IN SITU HYBRIDIZATION, FISH)技術と結合し、 遺伝子特異の反復配列を獲得し、異なるゲノム及び染色体上の分布特徴を分析した。REPEAT MASKERを用いて,族反復配列データベース(TRITICEAE REPEAT SEQUENCE データベース, TREP)及びNCBI GENBANKの特異的反復配列に対して比較分析を行った。 遺伝子の特異反復配列のPCRプライマーを設計した。FISH分析と特異的PCRプライマーを用いて、小麦- 由来の子孫を同定し、選択した。【結果】7つの 遺伝子の反復配列を得た。FISH分析により、それは10倍体のELONGATUと六倍体の中間体のすべての染色体の両腕において、いずれも型分布を呈し、しかも小麦の阻害DNAを添加しない場合、八倍体体小偃麦の中の と小麦染色体を明確に区別できることが明らかになった。それらをコムギ-偃麦草代の系統と転の分子細胞学的検出に適用し,特異的反復配列は不加封阻の染色体と染色体フラグメントを識別することができた。しかも、信号はゲノムハイブリダイゼーション(GENOMIC IN SITU HYBRIDIZATION, GISH)よりもっと特異的ではっきりしている。 遺伝子の特異反復配列に基づき、90対のプライマーを開発し、中国の春、10倍体のELONGATUと八倍体体小偃麦の増幅産物の比較分析により、36対(40%) 遺伝子の組のPCRマーカーを選出した。これらの特異的プライマーを利用して109の小麦- 誘導体をスキャンし、10対の増幅効果の良い特異的プライマーを発見し、その検出効率は73.3%-95%であった。[結論] 遺伝子の反復配列を獲得し、特異的PCR増幅プライマーを開発し、小麦の背景における 遺伝子の効率的な検出と追跡に応用できる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 六倍体 ,  染色体 ,  交雑 ,  コムギ ,  PCR法 ,  ゲノム ,  DNA【核酸】 ,  データベース ,  FISH ,  蛍光 ,  育種 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： アンプリコン ,  八倍体 ,  比較分析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： T. aestivum ,  Th. ponticum ,  genome specific repetitive sequences ,  FISH ,  PCR

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  麦  (FC03033M)

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子 ,  反復配列 ,  応用