特許
J-GLOBAL ID:201203084141272446
アレルゲンのエピトープ又はその候補の検出方法及びその利用
発明者:
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出願人/特許権者:
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代理人 (1件):
特許業務法人快友国際特許事務所
公報種別:再公表公報
出願番号(国際出願番号):JP2009005997
公開番号(公開出願番号):WO2010-052939
出願日: 2009年11月10日
公開日(公表日): 2010年05月14日
要約:
本明細書の開示は、一つのアレルゲンにおける2箇所以上のエピトープのセットを検出する方法を提供する。本明細書の開示によれば、アレルゲンのエピトープ又はその候補を検出するのにあたり、(a)被験試料として、複数のアレルギー陽性個体に由来する抗体を含有する被験試料群と、複数のアレルギー陰性個体に由来する抗体を含有する対照試料群とのそれぞれにつき、可能性あるアレルゲンタンパク質又はその一部のアミノ酸配列に基づく所定長の複数のオーバーラップペプチドが固定化されたアレイに、前記各群の試料をそれぞれ供給し、前記複数のオーバーラップペプチドと前記1種又は2種以上の抗体とを接触させ、前記複数のオーバーラップペプチドにつき、前記1種又は2種以上の抗体との特異的結合を検出し、前記複数のオーバーラップペプチドから選択されるオーバーラップペプチドであって、前記対照試料群から得られる前記オーバーラップペプチドの前記特異的結合の強度に関する平均対照強度情報と前記被験試料群から得られる前記オーバーラップペプチドの前記特異的結合の強度に関する平均被験強度情報とに基づいて、前記特異的結合が肯定される1種又は2種以上の前記オーバーラップペプチドを、前記アレルゲンにおける第1のエピトープ又はその候補とし、前記被験試料群から選択される被験試料に関し、前記1種又は2種以上の第1のエピトープ又はその候補に相当する前記オーバーラップペプチドの個別の被験強度情報と前記平均対照強度情報とに基づいて、前記オーバーラップペプチドを前記第1のエピトープ又はその候補とすることができるとき、当該第1のエピトープ又はその候補以外の他の前記オーバーラップペプチドから、前記平均対照強度情報に基づいて得られる臨界値以上あるいは当該臨界値を超える個別被験強度情報を有する1種又は2種以上の前記オーバーラップペプチドを前記アレルゲンにおける第2のエピトープ又はその候補とするようにする。
請求項(抜粋):
アレルゲンのエピトープ又はその候補を検出する方法であって、以下の工程;
(a)被験試料として、複数のアレルギー陽性個体に由来する抗体を含有する被験試料群と、複数のアレルギー陰性個体に由来する抗体を含有する対照試料群とのそれぞれにつき、
可能性あるアレルゲンタンパク質又はその一部のアミノ酸配列に基づく所定長の複数のオーバーラップペプチドが固定化されたアレイに、前記各群の試料をそれぞれ供給し、前記複数のオーバーラップペプチドと前記1種又は2種以上の抗体とを接触させる工程、
(b)前記複数のオーバーラップペプチドにつき、前記1種又は2種以上の抗体との特異的結合を検出する工程、
(c)前記複数のオーバーラップペプチドから選択されるオーバーラップペプチドであって、前記対照試料群から得られる前記オーバーラップペプチドの前記特異的結合の強度に関する平均対照強度情報と前記被験試料群から得られる前記オーバーラップペプチドの前記特異的結合の強度に関する平均被験強度情報とに基づいて、前記特異的結合が肯定される1種又は2種以上の前記オーバーラップペプチドを、前記アレルゲンにおける第1のエピトープ又はその候補とする工程、及び
(d)前記被験試料群から選択される被験試料に関し、前記1種又は2種以上の第1のエピトープ又はその候補に相当する前記オーバーラップペプチドの個別の被験強度情報と前記平均対照強度情報とに基づいて、前記オーバーラップペプチドを前記第1のエピトープ又はその候補とすることができるとき、当該第1のエピトープ又はその候補以外の他の前記オーバーラップペプチドから、前記平均対照強度情報に基づいて得られる臨界値以上あるいは当該臨界値を超える個別被験強度情報を有する1種又は2種以上の前記オーバーラップペプチドを前記アレルゲンにおける第2のエピトープ又はその候補とする工程、
を備える、方法。
IPC (2件):
FI (2件):
G01N33/53 Q
, G01N37/00 102
Fターム (7件):
4H045AA30
, 4H045BA10
, 4H045CA30
, 4H045CA40
, 4H045DA86
, 4H045EA50
, 4H045FA71
引用特許:
出願人引用 (1件)
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スギ花粉症の診断方法
公報種別:公開公報
出願番号:特願2006-288853
出願人:株式会社グリーンペプタイド
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