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J-GLOBAL ID：201502230852790312   整理番号：15A0327101

腸内細菌群集構造のメタゲノム解析

Metagenomics for Human Gut Microbiome

著者 (1件)： 山田拓司 (東京工業大学生命理工学研究科)
資料名： 腸内細菌学雑誌  (Journal of Intestinal Microbiology)
巻： 29  号： 1  ページ： 19-22 (J-STAGE)  発行年： 2015年 
JST資料番号： L0915A  ISSN： 1343-0882  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： ヒト腸内細菌解析は近年の次世代シーケンサーの爆発的な進歩によ...

シソーラス用語： 腸 ,...
準シソーラス用語： *腸内細菌科 ,...

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分類 (3件)： 腸  (EJ06040N) ,  消化器の基礎医学  (GH01020E) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C)

引用文献 (13件)：

• 1) Handelsman J, Rondon MR, Brady SF, Clardy J, Goodman RM. Molecular biological access to the chemistry of unknown soil microbes: a new frontier for natural products. Chem Biol. 1998; 5: R245-249.
• 2) Qin J, Li R, Raes J, Arumugam M, Burgdorf K S, Manichanh C, Nielsen T, Pons N, Levenez F, Yamada T, Mende DR, Li J, Xu J, Li S, Li D, Cao J, Wang B, Liang H, Zheng H, Xie Y, Tap J, Lepage P, Bertalan M, Batto JM, Hansen T, Le Paslier D, Linneberg A, Nielsen HB, Pelletier E, Renault P, Sicheritz-Ponten T, Turner K, Zhu H, Yu C, Li S, Jian M, Zhou Y, Li Y, Zhang X, Li S, Qin N, Yang H, Wang J, Brunak S, Doré J, Guarner F, Kristiansen K, Pedersen O, Parkhill J, Weissenbach J, Bork P, Ehrlich SD, Wang J. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. 2010; 464: 59-65.
• 3) Luo R, Liu B, Xie Y, Li Z, Huang W, Yuan J, He G, Chen Y, Pan Q, Liu Y, Tang J, Wu G, Zhang H, Shi Y, Liu Y, Yu C, Wang B, Lu Y, Han C, Cheung DW, Yiu SM, Peng S, Xiaoqian Z, Liu G, Liao X, Li Y, Yang H, Wang J, Lam TW, Wang J. SOAPdenovo2: an empirically improved memory-efficient short-read de novo assembler. Gigascience. 2012; 1: 18.
• 4) Namiki T, Hachiya T, Tanaka H, Sakakibara Y. MetaVelvet: an extension of Velvet assembler to de novo metagenome assembly from short sequence reads. Nucleic Acids Res. 2012; 40: e155.
• 5) Peng Y, Leung HC, Yiu SM, Chin FY. Meta-IDBA: a de Novo assembler for metagenomic data. Bioinformatics. 2011; 27: i94-101.

タイトルに関連する用語 (3件)： 腸内細菌 ,  群集構造 ,  メタゲノム解析