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J-GLOBAL ID：201602221831625231   整理番号：16A1309495

イネ:全ゲノム配列解読によるゲノムワイド関連解析がイネの農業形質に影響する新たな遺伝子を迅速に同定する

Genome-wide association study using whole-genome sequencing rapidly identifies new genes influencing agronomic traits in rice

著者 (11件)： YANO Kenji (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  AYA Koichiro (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  TAKEUCHI Hideyuki (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  LO Pei-ching (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  HU Li (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  KITANO Hidemi (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  HIRANO Ko (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  MATSUOKA Makoto (Nagoya Univ., Nagoya, JPN) ,  YAMAMOTO Eiji (NARO, Tsu, JPN) ,  YAMASAKI Masanori (Kobe Univ., Hyogo, JPN) ,  YOSHIDA Shinya (Hyogo Prefectural Res. Center for Agriculture, Forestry and Fisheries, Hyogo, JPN)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 48  号： 8  ページ： 927-934  発行年： 2016年08月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 作物の農業的有用形質に関与する遺伝子の同定において,ゲノムワイド関連解析(GWAS)が強力なツールとなる場合があるが,集団構造および大規模な連鎖不平衡がしばしばその妨げとなることが知られている。本研究では,全ゲノム配列解読に基づくGWASを利用して農業上重要なイネ遺伝子を同定し,推定される塩基多型の影響に基づいて候補遺伝子のスクリーニングを行った。この方法により,農業形質と関係する新規遺伝子が4個同定された。その一部は一般的な多型解析では検出されなかったが,遺伝子に基づく関連解析を行うことで検出することができた。今回の研究は,農業形質に関与する遺伝子のGWASによる迅速同定に関する重要な洞察をもたらすものであり,作物の改良を目指す今後の研究を促進すると考えられる。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： *イネ ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  *表現型 ,  ヌクレオチド配列 ,  同定 ,  一塩基多型 ,  育種 ,  遺伝学実験技術 ,  遺伝的連鎖 ,  ゲノム配列 ,  *遺伝子同定 ,  *農業形質 ,  連鎖不平衡 ,  配列解析
準シソーラス用語： 連鎖 ,  シークエンシング ,  全ゲノム配列解読 ,  品種改良

分類 (4件)： 遺伝学一般  (EC01010C) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  作物の品種  (FC02020V) ,  稲作  (FC03020C)

タイトルに関連する用語 (7件)： イネ ,  ゲノム配列 ,  解読 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  農業形質 ,  遺伝子 ,  同定