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J-GLOBAL ID：201702254755981633   整理番号：17A0924463

エネルギー表示法を用いた蛋白質複合体ドッキングモデルの結合性評価

著者 (2件)： 竹村和浩 (東大 分子細胞生物学研) ,  北尾彰朗 (東大 分子細胞生物学研)
資料名： SAR News (Web)  (SAR News (Web))
号： 32  ページ： 19-25 (WEB ONLY)  発行年： 2017年04月01日 
JST資料番号： U1076A  ISSN： 2436-9152  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： エネルギー表示法により溶媒和自由エネルギーを高精度に評価し,...

シソーラス用語： 表示 ,...
準シソーラス用語： エネルギー表示法 ,...

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分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

引用文献 (20件)：

• Lensink, M.F., Velankar, S., Wodak, S.J. Modeling protein-protein and protein-peptide complexes: CAPRI 6th edition, Proteins, 85, 359-377. (2017) doi: 10.1002/prot.25215.
• Matubayasi, N., Nakahara, M. Theory of solutions in the energetic representation. I. formulation, J. Chem. Phys., 113, 6070-6081 (2000).
• Matubayasi, N., Nakahara, M. Theory of solutions in the energy representation. II. functional for the chemical potential, J. Chem. Phys., 117, 3605-3616 (2002); J. Chem. Phys. 118, 2446 (2003) (erratum).
• Matubayasi, N., Nakahara, M. Theory of solutions in the energy representation. III. treatment of the molecular flexibility, J. Chem. Phys., 119, 9686-9702 (2003).
• Karino, Y., Matubayasi, N. Free-energy analysis of hydration effect on protein with explicit solvent: equilibrium fluctuation of cytochrome c, J. Chem. Phys., 134, 041105 (2011).

タイトルに関連する用語 (7件)： エネルギー ,  表示法 ,  蛋白質複合体 ,  ドッキング ,  モデル ,  結合性 ,  評価