- 2021 - 2025 持続的作物生産に向けたクラスター根の形成能とリン供給能の活用
- 2017 - 2020 根分泌科学の新展開:農業生産への活用と生態学的機能
- 2016 - 2019 退化的な胞子体をもつコケ植物の形態進化:蘚類センボンゴケ科を例に
- 2011 - 2015 分子マーカーを用いた日本列島のコケ植物の遺伝構造と空中のリソースに関する研究
- 2011 - 2014 コケ植物主要分類群の系統関係を明らかにするための葉緑体ゲノム系統学の展開
- 2008 - 2010 海洋島の蘚苔類多様性を明らかにし,絶海の孤島への種の移入経路と種分化を探る
- 2007 - 2010 蘚苔類の大綱分類体系に関与する伝統的形質の再検討と新分類体系構築への総合的研究
- 2006 - 2008 ハイゴケ科の再定義に関する系統分類学的研究
- 2003 - 2006 分子系統学的知見に基づく蘚類ハイゴケ科・ナガハシゴケ科の新分類体系の構築
- 2004 - 2006 島を渡り,コケ植物の配偶体はどのように進化し,分化したのか?
- 2003 - 2006 蘚苔類の分類体系の再検討-頂端分裂細胞の分裂様式と分子データからのアプローチ-
- 2002 - 2004 分子情報抽出のための植物標本作製法の改良に関する基礎研究
- 2001 - 2003 分子系統学的知見に基づく蘚類ハイゴケ目の新分類体系の構築
- 2002 - 藻類スミレモの分子系統学的研究
- 2000 - Molecular phylogeny and systematics of bryophytes
- 2000 - コケ植物の分子系統学的・分類学的研究
- 蘚類Trismegistia属の分子系統学的位置
- 蘚類ハイゴケ目内の分子系統学的関係
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