研究者
J-GLOBAL ID:200901023254452503   更新日: 2024年09月12日

鴫 直樹

シギ ナオキ | Shigi Naoki
所属機関・部署:
職名: 副ラボ長
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
ホームページURL (1件): https://unit.aist.go.jp/cbbd-oil/
研究分野 (2件): 構造生物化学 ,  機能生物化学
研究キーワード (6件): 無酸素生化学実験 ,  酸素 ,  硫黄 ,  RNA修飾 ,  翻訳後修飾 ,  タンパク質合成
競争的資金等の研究課題 (19件):
  • 2024 - 2026 バクテリア原始ユビキチンによるリジン残基の修飾を介したタンパク質の機能制御
  • 2024 - 2026 過硫化硫黄中間体を経由する硫黄化合物の生合成のしくみの多様性とその進化
  • 2021 - 2024 tRNA硫黄修飾塩基の生合成・分解系の多様性とその分子基盤
  • 2021 - 2023 バクテリアに現存するユビキチンの始原機能
  • 2020 - 2023 原始的硫黄転移系の分子基盤
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論文 (21件):
  • Ryota Hidese, Takayuki Ohira, Satsuki Sakakibara, Tsutomu Suzuki, Naoki Shigi, Shinsuke Fujiwara. Functional redundancy of ubiquitin-like sulfur-carrier proteins facilitates flexible, efficient sulfur utilization in the primordial archaeon Thermococcus kodakarensis. mBio. 2024. in press
  • Yuzuru Sugio, Ryota Yamagami, Naoki Shigi, Hiroyuki Hori. A selective and sensitive detection system for 4-thiouridine modification in RNA. RNA (New York, N.Y.). 2022
  • Naoki Shigi. Biosynthesis and Degradation of Sulfur Modifications in tRNAs. International journal of molecular sciences. 2021. 22. 21
  • Minghao Chen, Masato Ishizaka, Shun Narai, Masaki Horitani, Naoki Shigi, Min Yao, Yoshikazu Tanaka. The [4Fe-4S] cluster of sulfurtransferase TtuA desulfurizes TtuB during tRNA modification in Thermus thermophilus. Communications biology. 2020. 3. 1. 168-168
  • Shigi N, Horitani M, Miyauchi K, Suzuki T, Kuroki M. An ancient type of MnmA protein is an iron-sulfur cluster-dependent sulfurtransferase for tRNA anticodons. RNA. 2019. 26. 3. 240-250
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書籍 (11件):
  • 技術で未来拓く産総研の挑戦(303)~たんぱく質の合成、硫黄修飾が重要な役割~
    日刊工業新聞 2024
  • 極限環境微生物の先端科学と社会実装最前線
    エヌ・ティー・エス 2023 ISBN:9784860438487
  • 鉄硫黄クラスターが関与するtRNAの硫黄修飾塩基の生合成機構
    硫酸協会 2020
  • 高度好熱菌を耐熱化するtRNA硫黄修飾塩基の生合成と機能の解明
    極限環境生物学会 学会事務局 2019
  • RNA チオ化
    金原一郎記念医学医療振興財団 2018
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講演・口頭発表等 (8件):
  • RNAと硫黄 ~鉄硫黄クラスターと初期進化~
    (生命システム原材料の起源と進化研究会&ThermusQ研究会 研究交流会 2024)
  • tRNA 硫黄化酵素の酸素感受性の反応機構とその環境適応進化
    (遺伝研研究会「エピトランスクリプトーム制御の分子機構と生理機能」 2024)
  • Biosynthesis and Functions of Sulfur Modifications of Transfer RNA
    (30th Tokyo RNA Club 2022)
  • Biosynthesis and Functions of Sulfur Modifications of Transfer RNA
    (Weekly ESLI seminar (online), Tokyo Institute of Technology 2021)
  • 高度好熱菌を耐熱化するtRNA硫黄修飾塩基の生合成と機能の解明
    (極限環境生物学会 年会 研究奨励賞受賞講演 2017)
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学歴 (3件):
  • 2001 - 2004 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 先端生命科学専攻 博士課程 (渡辺公綱教授)
  • 1999 - 2001 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 先端生命科学専攻 修士課程
  • 1997 - 1999 東京大学工学部 化学生命工学科
学位 (1件):
  • 博士(生命科学) (東京大学大学院新領域創成科学研究科)
経歴 (9件):
  • 2023/04 - 現在 産総研・早大 生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ 副ラボ長
  • 2016/04 - 現在 岐阜大学大学院 連合農学研究科 客員准教授
  • 2022/04 - 2023/03 経済産業省 生物化学産業課 課長補佐 (ホワイトバイオ担当)
  • 2020/04 - 2023/03 産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門 主任研究員
  • 2015/04 - 2020/03 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 主任研究員
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委員歴 (3件):
  • 2024/04 - 現在 極限環境生物学会 幹事(学術担当)
  • 2010/11 - 現在 Review editorial board; Frontiers in Genetics
  • 2020/04 - 2022/03 極限環境生物学会 幹事(年会担当)
受賞 (1件):
  • 2017/11 - 極限環境生物学会 研究奨励賞 高度好熱菌を耐熱化するtRNA硫黄修飾塩基の生合成と機能の解明
所属学会 (4件):
極限環境生物学会 ,  日本RNA学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本生化学会
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