研究者
J-GLOBAL ID：200901030728675050   更新日: 2024年01月31日

岡本 祐幸

オカモト ユウコウ | Okamoto Yuko
所属機関・部署：
名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻

名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻 について


職名： 教授
ホームページURL (2件)： https://www.phys.nagoya-u.ac.jp/list/HPtemplate/HPtemplate_Okamoto_j.pdf ,  https://www.phys.nagoya-u.ac.jp/en/list/HPtemplate/HPtemplate_Okamoto_e.pdf
研究キーワード (5件)： レプリカ交換法 ,  焼き戻し法 ,  マルチカノニカル法 ,  拡張アンサンブル法 ,  タンパク質折りたたみの計算機シミュレーション
競争的資金等の研究課題 (14件)：
  • 2013 - 2018 生体分子集団および人工分子集団の相互作用と大規模構造転換
  • 2013 - 2018 拡張アンサンブル法による蛋白質への小分子結合機構の研究
  • 2013 - 2015 拡張アンサンブル密度汎関数分子動力学法によるATP加水分解の研究
  • 2011 - 2014 拡張アンサンブルシミュレーションによるタンパク質とリガンドの結合構造予測法の開発
  • 2008 - 2013 構造ゆらぎを促進する分子シミュレーション手法の開発と自由エネルギー計算
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論文 (261件)：
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MISC (255件)：
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書籍 (37件)：
  • Optimizations of protein force fields in <i>Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes</i>
    Springer Berlin Heidelberg 2019 ISBN:9783642285530
  • Optimizations of protein force fields in <i>Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes</i>
    Springer Berlin Heidelberg 2019 ISBN:9783319958422
  • Conformational Dynamics of Oligosaccharides Characterized by Paramagnetism-Assisted NMR Spectroscopy in Conjunction with Molecular Dynamics Simulation, in <i>Biochemical Roles of Eukaryotic Cell Surface Macromolecules</i>
    Springer 2015 ISBN:9783319112794
  • Protein folding simulations by generalized-ensemble algorithms, in <i>Advances in Experimental Medicine and Biology</i>
    Springer, Berlin 2013 ISBN:9783319029702
  • Enhanced sampling algorithms, in <i>Biomolecular Simulations: Methods and Protocols</i>
    Humana Press 2013
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講演・口頭発表等 (239件)：
  • Enhanced sampling techniques for classical and quantum molecular simulations
    (The 5th International Conference on Molecular Simulation (ICMS 2019) 2019)
  • Enhanced sampling methods for complex spin and molecular systems
    (Molecular Simulation 2019 Meeting 2019)
  • Enhanced sampling simulations for water and biomolecules
    (The 10th Toyota RIKEN International Workshop on Science of Life Phenomena Woven by Water and Biomolecules 2019)
  • Enhanced sampling methods for classical and quantum simulations
    (The 4th International Conference on Computational Science and Engineering (ICCSE-4) 2019)
  • Enhanced sampling techniques for free energy calculations
    (Free Energy Calculations: Entering the Fourth Decade of Adventure in Chemistry and Biophysics 2019)
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学位 (4件)：
  • 理学士ー理学修士 (ブラウン大学)
  • 理学博士 (コーネル大学)
  • Bachelor of Science - Master of Science (B.S.-M.S.) (Brown University)
  • Doctor of Philosophy (Ph.D.) (Cornell University)
経歴 (17件)：
  • 2011/04/01 - 現在 名古屋大学 大学院工学研究科 附属計算科学連携教育研究センター 教授
  • 2010/06/01 - 現在 名古屋大学 情報基盤センター 大規模計算支援環境研究部門/情報基盤 教授
  • 2007/02/01 - 現在 名古屋大学 附属構造生物学研究センター 教授
  • 2007/02/01 - 現在 名古屋大学 大学院理学研究科 附属構造生物学研究センター 教授
  • 2005/04/01 - 現在 名古屋大学大学院理学研究科物質理学専攻(物理系) 教授
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所属学会 (9件)：
米国化学会 ,  米国物理学会 ,  理論化学研究会 ,  分子科学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  分子シミュレーション研究会 ,  日本化学会 ,  日本生物物理学会 ,  日本物理学会
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