研究者
J-GLOBAL ID：200901031632447753   更新日: 2024年05月08日

中村 周吾

ナカムラ シュウゴ | NAKAMURA Shugo
所属機関・部署：
東洋大学 情報連携学部

東洋大学 情報連携学部 について


職名： 教授
研究分野 (3件)： 生命、健康、医療情報学 ,  知能情報学 ,  統計科学
研究キーワード (4件)： 生命情報科学 ,  生物情報工学 ,  計算機科学 ,  information science
競争的資金等の研究課題 (27件)：
  • 2009 - 2011 コンピュータを用いたディスオーダー蛋白質の構造情報の網羅的解析
  • 2008 - 2010 タンパク質の不規則領域のデータベースの構築と機能解析
  • 2008 - 2010 タンパク質相互作用のネットワーク予測から原子レベルの結合予測までの統合的研究
  • 2007 - 2008 タンパク質の局所配列・構造情報に着目した機能予測法の開発
  • 2006 - 2007 高精度のドッキング機能を有するタンパク質間相互作用予測システムの開発
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論文 (116件)：
  • Tuan Nguyen, Hirotada Honda, Takashi Sano, Vinh Nguyen, Shugo Nakamura, Tan Minh Nguyen. From Coupled Oscillators to Graph Neural Networks: Reducing Over-smoothing via a Kuramoto Model-based Approach. Proceedings of The 27th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS2024). 2024. PMLR 238. 2710-2718
  • Phuong Dinh, Deddy Jobson, Takashi Sano, Hirotada Honda, Shugo Nakamura. Understanding Neural ODE prediction decision using SHAP. Proceedings of the 5th Northern Lights Deep Learning Conference (NLDL). 2024. PMLR 233. 53-58
  • 上野 允照, 佐野 崇, 本多 泰理, 中村 周吾. 自然言語処理技術を用いた詐欺的な暗号資産の検出方法. 人工知能学会論文誌. 2023. 38. 5. E-N34_1
  • Md Abdulla Al Mamun, Wei Cao, Shugo Nakamura, Jun-Ichi Maruyama. Large-scale identification of genes involved in septal pore plugging in multicellular fungi. Nature communications. 2023. 14. 1. 1418-1418
  • Hirotada Honda, Takashi Sano, Shugo Nakamura, Mitsuaki Ueno, Hiroki Hanazawa, Nguyen Manh Duc Tuan. An ODE-based neural network with Bayesian optimization. JSIAM Letters. 2023. 15. 101-104
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MISC (98件)：
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書籍 (8件)：
  • 分子シミュレーションによるHCVポリメラーゼの薬剤耐性変異解析, 消化器・肝臓内科 第6巻第6号 特集 II.新規技術の肝臓病研究への応用
    科学評論社 2019
  • バイオインフォマティクスと分子動力学シミュレーション, 先端医療シリーズ49「消化器疾患の最新医療」
    先端医療技術研究所 2018
  • タンパク質立体構造予測 -de novoモデリング-, 遺伝子医学MOOK 14「次世代創薬テクノロジー 実践:インシリコ創薬の最前線」, 竹田-志鷹, 梅山編, 49-54
    メディカルドゥ 2009
  • バイオインフォマティクス・コンピューティング, Bryan Bergeron著, 清水, 中村監訳
    オーム社 2004
  • 分子シミュレーションの並列計算法, 化学フロンティア8「生体系のコンピュータ・シミュレーション」, 岡崎, 岡本編, 50-62
    化学同人 2002
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講演・口頭発表等 (14件)：
  • 機械学習法・深層学習の手法概要と生命科学分野への応用
    (BPCNPNPPP4学会合同年会)
  • 機械学習・深層学習と生命科学
    (計算生命科学の基礎8 2021)
  • 機械学習・深層学習と生命科学
    (計算生命科学の基礎VII 2020)
  • 肝炎研究へのバイオインフォマティクスによるアプローチ例
    (日本肝臓学会大会・ランチョンセミナーC 2019)
  • 生命科学データのデータマイニングと分子シミュレーション ~タンパク質凝集性解析とNSAIDs・トレハロース相互作用解析~
    (第161回日本獣医学会学術集会 2018)
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学歴 (4件)：
  • 1991 - 1995 東京大学 大学院農学系研究科 応用生命工学専攻
  • - 1995 東京大学
  • 1989 - 1991 東京大学 工学部 計数工学科
  • - 1991 東京大学
学位 (2件)：
  • 修士(農学) (東京大学)
  • 博士(農学) (東京大学)
経歴 (7件)：
  • 2017/04 - 現在 東洋大学 情報連携学部 教授
  • 2016/04 - 2017/03 東京大学 大学院農学生命科学研究科 准教授
  • 2002/02 - 2017/03 Associate Professor, The Univ. of Tokyo
  • 2012/04 - 2016/03 東京大学 大学院情報学環 准教授
  • 2002/02 - 2012/03 東京大学 大学院農学生命科学研究科 准教授
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所属学会 (5件)：
日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  生物物理学会 ,  情報計算化学生物学会 ,  人工知能学会
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