清水佳奈

シミズカナ | Shimizu Kana

所属機関・部署：
ホームページURL (1件)： https://iskana.github.io/works.html

研究分野 (1件)：生命、健康、医療情報学

研究キーワード (6件)：アルゴリズム , プライバシ保護データマイニング , データマイニング , ゲノム情報解析 , 生命情報科学 , バイオインフォマティクス

競争的資金等の研究課題 (11件)：

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論文 (29件)：

Nozomi Hasegawa, Kana Shimizu. Efficient Colored de Bruijn Graph for Indexing Reads. J. Comput. Biol. 2023. 30. 6. 648-662
Yoshiki Nakagawa, Satsuya Ohata, Kana Shimizu. Efficient privacy-preserving variable-length substring match for genome sequence. (Extended version). Algorithms for molecular biology : AMB. 2022. 17. 1. 9-9
Mohammad Nabil Ahmed, Kana Shimizu. Private Evaluation of a Decision Tree Based on Secret Sharing. ICISC. 2022. 171-194
Yoshiki Nakagawa, Satsuya Ohata, Kana Shimizu. Efficient Privacy-Preserving Variable-Length Substring Match for Genome Sequence. 21st International Workshop on Algorithms in Bioinformatics(WABI). 2021. 2-23
Naoki Matsuo, Natsuko Goda, Kana Shimizu, Satoshi Fukuchi, Motonori Ota, Hidekazu Hiroaki. Discovery of cryoprotective activity in human genome-derived intrinsically disordered proteins. International Journal of Molecular Sciences. 2018. 19. 2. E401

MISC (24件)：

清水佳奈, 坂本一憲, 坂本一憲, 笠原雅弘. アルゴリズムの頂が持つ力はいかに?-ゲノコン2021開催記録-. 情報処理. 2022. 63. 7
中川, 佳貴, 大畑, 幸矢, 清水, 佳奈. 秘密分散に基づく秘匿全文検索. コンピュータセキュリティシンポジウム2019論文集. 2019. 2019. 289-296
清水, 佳奈. 5分で分かる ! ? 有名論文ナナメ読み:Ferragina, P. and Manzini, G. : Opportunistic Data Structures with Applications. 情報処理. 2019. 60. 6. 554-556
清水佳奈. 生体情報セキュリティ. 生体医工学. 2019. Annual57. Abstract. S131_2-S131_2
飯野, 翼, 大上, 雅史, 秋山, 泰, 清水, 佳奈. タンパク質分子の柔軟性を考慮した新規ドッキングゲーム. 第80回全国大会講演論文集. 2018. 2018. 1. 931-932

書籍 (2件)：

「個人ゲノム情報の活用とプライバシー保護」, プレシジョン・メディシン ~ビッグデータの構築・分析から臨床応用・課題まで~
エヌ・ティー・エス 2018 ISBN:9784860435806
"POODLE: tools predicting intrinsically disordered regions of amino acid sequence", Protein Structure Prediction 3rd Edition
Springer 2014 ISBN:9781493903665

講演・口頭発表等 (8件)：

Privacy-aware computational genomics
(SPIEZ Convergence 2018 2018)
Privacy-preserving genome sequence search
(2016 International Workshop on Spatial and Temporal Modeling from Statistical, Machine Learning and Engineering perspectives (STM2016) 2016)
Efficient Privacy-Preserving String Search and an Application in Genomics
(High Throughput Sequencing Algorithms & Applications (HitSeq 2015), A SIG of ISMB/ECCB 2015 2015)
Privacy Preserving Similarity Search in Biomedical Data by Homomorphic encryption
(Biological Data Science 2014)
Next generation sequencing data analyses by using ultra-fast all pairs similarity search
(International Symposium on Single Biomolecule Analysis 2013 2013)

学歴 (5件)：

学位 (1件)：

経歴 (7件)：

2018/04 - 早稲田大学理工学術院教授
2016/04 - 2018/03 早稲田大学理工学術院准教授
2013/03 - 2016/03 産業技術総合研究所創薬基盤研究部門/ゲノム情報研究センター/生命情報工学研究センター主任研究員
2013/12 - 2015/04 The Sloan-Kettering Institute at Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Visiting Investigator
2009/04 - 2013/02 産業技術総合研究所生命情報工学研究センター研究員

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委員歴 (13件)：

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受賞 (11件)：

2022/09 - 公益財団法人KDDI財団 KDDI Foundation Award2022, 業績賞 Society5.0時代の生命科学を支えるプライバシ保護技術の研究
2021 - 2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021)優秀ポスター賞
2019 - コンピュータセキュリティシンポジウム2019(CSS2019)奨励賞
2018/04 - 平成30年度科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞(研究部門)
2016/10 - 生命医薬情報学連合大会2016年大会研究奨励賞

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清水 佳奈