研究者
J-GLOBAL ID：200901044232295363   更新日: 2024年11月20日

作村 諭一

サクムラ ユウイチ | Sakumura Yuichi
所属機関・部署：
奈良先端科学技術大学院大学 データ駆動型サイエンス創造センター

奈良先端科学技術大学院大学 データ駆動型サイエンス創造センター について


職名： 教授
ホームページURL (1件)： https://ncb.naist.jp
研究分野 (5件)： 生物物理学 ,  生命、健康、医療情報学 ,  ソフトコンピューティング ,  システムゲノム科学 ,  神経科学一般
研究キーワード (28件)： システム生物学 ,  統計解析 ,  形態形成 ,  シグナル伝達 ,  分子生物学 ,  システム同定 ,  軸索誘導 ,  生物形態 ,  膜電位 ,  ベイズ推定 ,  細胞形態 ,  数理生物 ,  発生 ,  分節化 ,  生物時計 ,  神経成長 ,  軸索伸長 ,  Notch シグナル ,  シミュレーション ,  体節 ,  分子時空間計測 ,  Rhoファミリー低分子量Gタンパク質 ,  細胞運動 ,  推論問題 ,  非線型力学 ,  システム神経生物学 ,  Protein Interaction Nonlinear Dynamics ,  Brain Information
競争的資金等の研究課題 (22件)：
  • 2023 - 2025 定量細胞モデルによる血管新生の秩序力学の解明
  • 2021 - 2024 歯周病原細菌が心房細動の病態に及ぼす影響に関する総合的研究
  • 2020 - 2023 呼気成分による複数疾病のAI診断と生物学的基盤に関する研究
  • 2018 - 2020 細胞の社会的ふるまいを軸とした発生過程のロバストな器官サイズ決定機構の新展開
  • 2017 - 2019 体節細胞の速い同調を構成する細胞モデルと検証
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論文 (49件)：
  • Tomoki Ohkubo, Yuichi Sakumura, Fuzhong Zhang, Katsuyuki Kunida. A hybrid in silico/in-cell controller that handles process-model mismatches using intracellular biosensing. Scientific Reports. 2024. 14. 1
  • Chen Xing, Yuichi Sakumura, Toshiya Kokaji, Katsuyuki Kunida, Noriaki Sasai. Stepwise Bayesian Machine Learning Uncovers a Novel Gene Regulatory Network Component in Neural Tube Development. 2024
  • Kio Yagami, Kentarou Baba, Takunori Minegishi, Shinji Misu, Hiroko Katsuno-Kambe, Kazunori Okano, Yuichi Sakumura, Yoichiroh Hosokawa, Naoyuki Inagaki. Cell morphogenesis via self-propelled treadmilling actin waves. 2024
  • Tomoki Ohkubo, Yuichi Sakumura, Katsuyuki Kunida. On-Line Reoptimization of Mammalian Fed-Batch Culture Using a Nonlinear Model Predictive Controller. New Generation Computing. 2023
  • Ryosuke Fujikawa, Chika Okimura, Satoshi Kozawa, Kazushi Ikeda, Naoyuki Inagaki, Yoshiaki Iwadate, Yuichi Sakumura. Bayesian traction force estimation using cell boundary-dependent force priors. Biophysical Journal. 2023
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MISC (34件)：
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書籍 (5件)：
  • 半導体式ガスセンサによる呼気分析と統計解析
    電気化学 2018
  • Quantitative Modeling of Neuronal Polarization
    IGI global 2012
  • 神経細胞が突起の長さを検知する仕組みと神経細胞の対称性の破れ
    エヌ・ティー・エス 2011
  • 細胞形態変化の定量と現象論的モデル
    秀潤社 2010
  • 神経の可塑性と発達の生体反応モデリング
    羊土社 2007
講演・口頭発表等 (74件)：
  • Feature Selection using Distance from Classification Boundary and Monte Carlo Simulation
    (The 25th International Conference on Neural Information Processing (ICONIP 2018) 2018)
  • Stochasticity Promotes Synchronized Gene Expression between Cells in Somite Segmentation
    (第27回 日本数理生物学会年会 2017)
  • 細胞性粘菌の運動の数理モデル
    (バイオメカニクス研究会 2015)
  • 軸索伸長の抑制因子と因子阻害剤の浸透率の推定
    (電子情報通信学会技術研究報告 2015)
  • 神経細胞の形態形成モデル
    (立命館大学視覚科学統合研究センターシンポジウム 2014)
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学歴 (3件)：
  • 1996 - 1999 東京大学 大学院 工学系研究科 博士課程
  • 1994 - 1996 東京大学 大学院 工学系研究科 修士課程
  • 1990 - 1994 東京工業大学 理学部 物理学科
学位 (1件)：
  • 博士(工学) (東京大学)
経歴 (8件)：
  • 2021/04 - 現在 奈良先端科学技術大学院大学 データ駆動型サイエンス創造センター 教授
  • 2018/04 - 2021/03 奈良先端科学技術大学院大学 先端科学技術研究科 准教授
  • 2017/04 - 2018/03 奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科 准教授
  • 2012/04 - 2017/03 愛知県立大学 情報科学部 准教授
  • 2011/04 - 2012/03 奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科 特任准教授
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委員歴 (4件)：
  • 2015/04 - 現在 Journal of the Physical Society of Japan 編集委員
  • - 現在 電子情報通信学会 編集委員
  • 2008/04 - 2012/03 日本神経回路学会 理事
  • 2008/04 - 2011/03 日本神経科学学会 神経科学ニュース編集委員
所属学会 (7件)：
アジア太平洋神経回路学会 ,  北米神経科学学会 ,  電子情報通信学会ソサイエティ論文誌 編集委員会 ,  Biophysical Society ,  日本物理学会 ,  日本生物物理学会 ,  日本神経科学学会
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