研究者
J-GLOBAL ID：200901045012748380
更新日: 2024年11月09日
小松崎 民樹
コマツザキ タミキ | TAMIKI KOMATSUZAKI
所属機関・部署：
職名：
本務/教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：
ホームページURL (1件)：
http://mlns.es.hokudai.ac.jp/
研究分野 (4件)：
生物物理学
, 基礎物理化学
, 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理
, 数理物理、物性基礎
研究キーワード (5件)：
情報計測 時系列解析 データマイニング 生体情報 非平衡・非線形物理学 統計物理学 化学物理 生物物理 化学反応 分子動力学 タンパク質・核酸の構造・動態・機能 フォールディング 1分子計測・操作 非平衡・複雑系
, Functions Folding Single Molecule Measurement Complex Systems
, Dynamics
, Nolinear Physics Statistical Physics Chemical Physics Biological Physics Chemical Reaction Molecular Dynamics Protein Structure
, Time Series Analysis Data Mining Biological Information Nonequilibrium
競争的資金等の研究課題 (39件)：
- 2023 - 2029 個体差を活かした計測介入型の迅速スクリーニング計測基盤
- 2018 - 2023 細胞集団とシンギュラリティ細胞のデータ駆動型数理解析技術の開発
- 2016 - 2022 一細胞ラマン計測と情報科学の融合による細胞診断の迅速解析技術の開発
- 2018 - 2021 1細胞ラマン分光イメージングのための情報計測技術
- 2018 - 2020 データサイエンスと非線形科学の融合による新たな非平衡現象の探求
- 2017 - 2020 生命動態システムに対する分子データ科学の構築
- 2018 - 2019 1細胞ラマン分光イメージングに基づく細胞場の分子データ科学
- 2016 - 2019 細胞の集団と少数性のシステム生物学
- 2017 - 2018 多階層システム生物学におけるデータ駆動科学の展開
- 2015 - 2018 少数系から複雑反応ネットワークを含む遷移状態概念の深化と制御
- 2016 - 2017 多階層システム生物学におけるデータ駆動科学の展開
- 2011 - 2016 少数性生物学ー個と多数の狭間が織りなす生命現象の探求ー
- 2013 - 2016 分子個性を彫り出すシステム生物学の探求
- 2013 - 2016 階層性と頑健性をもつ生命動態システムの解析基盤構築
- 2011 - 2016 少数分子反応ネットワーク理論の構築-少数性と階層性の観点からのモデリング-
- 2011 - 2011 生体機能システムの頑健性と適応性の基本原理の探索
- 2009 - 2011 単一量子ドットのブリンキング機構の解明・制御に向けた新しい解析理論の開発
- 2009 - 2011 生体機能における時空間階層を繋ぐ選択性と統計性の動的構築原理の創出
- 2009 - 2010 1分子時系列情報に基づく革新的マルチスケールモデリング
- 2008 - 2009 複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築
- 2006 - 2007 複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築
- 2004 - 2006 多自由度カオスの相空間構造に基付く非平衡反応動力学の構築
- 2004 - 2005 相空間構造に基づく多遷移反応動力学とメソスケールで発現する新規なダイナミックス
- 2003 - 2005 化学反応および生体分子系における反応選択性・記憶の動的発現原理
- 2003 - 2003 相空間構造に基づく多遷移反応動力学とメソスケールで発現する新規なダイナミックス
- 2003 - 2003 1分子時系列情報に基づく生体分子の構造転移パスウェイの多重性・多型性解析
- 2002 - 2002 アミノ酸配列空間上の蛋白質の折れ畳みダイナミックスにおける規則的階層性の探索
- 2001 - 2001 アミノ酸配列空間上の蛋白質の折れ畳みダイナミックスにおける規則的階層性の探索
- 2000 - 2001 遷移ダイナミックスの規則性・非統計性と化学反応動力学理論
- 2000 - 2001 化学反応における遷移過程の動力学的階層構造に関する研究
- 蛋白質折り畳みにおける分子遷移のカオスと複雑性
- 1分子時系列情報に基づく反応ネットワーク構造の構成論とその複雑さ解析
- 生体分子機能および化学反応網における選択性と統計性のダイナミックス基盤の創生
- 蛋白質の折り畳み運動解明を目指した一分子観測法の確立-一分子観察実験のための新しいデータ解析手法の開発
- Nonequilibrium Reaction Dynamics Theory Based on the Geometrical Structure of Phase Space
- Chaos and complexity in the dynamics of molecular transitions during protein folding
- A Constructive Theory of Reaction Network and Complexity Analysis from Single Molecule Time Series
- An Establishment of Dynamical Foundations of Selectivity and Stochasticity in Biomolecule Functions
- New Single Molecule Measurement toward full understanding of the complexity of Protein Folding
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論文 (171件)：
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Ryoichi Tanaka, Yuta Mizuno, Takuro Tsutsumi, Mikito Toda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki. Low-dimensional projection of reactivity classes in chemical reaction dynamics using supervised dimensionality reduction. The Journal of chemical physics. 2024. 161. 15
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Md Menhazul Abedin, Koji Tabata, Yoshihiro Matsumura, Tamiki Komatsuzaki. Multi-armed bandit algorithm for sequential experiments of molecular properties with dynamic feature selection. The Journal of chemical physics. 2024. 161. 1
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Yutaka Nagahata, Masato Kobayashi, Mikito Toda, Satoshi Maeda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki. An encompassed representation of timescale hierarchies in first-order reaction network. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2024. 121. 21. e2317781121
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Koji Tabata, Hiroyuki Kawagoe, J Nicholas Taylor, Kentaro Mochizuki, Toshiki Kubo, Jean-Emmanuel Clement, Yasuaki Kumamoto, Yoshinori Harada, Atsuyoshi Nakamura, Katsumasa Fujita, et al. On-the-fly Raman microscopy guaranteeing the accuracy of discrimination. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2024. 121. 12. e2304866121
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Xun Sun, Jonas Alfermann, Hao Li, Maxwell B Watkins, Yi-Tsao Chen, Thomas E Morrell, Florian Mayerthaler, Chia-Ying Wang, Tamiki Komatsuzaki, Jhih-Wei Chu, et al. Subdomain dynamics enable chemical chain reactions in non-ribosomal peptide synthetases. Nature chemistry. 2024. 16. 2. 259-268
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MISC (331件)：
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Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki. Quantum algorithm for dynamic mode decomposition integrated with a quantum differential equation solver. Physical Review Research. 2024
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Ryoichi Tanaka, Yuta Mizuno, Takuro Tsutsumi, Mikito Toda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki. Low-Dimensional Projection of Reactive Islands in Chemical Reaction Dynamics Using a Supervised Dimensionality Reduction Method. arXiv. 2024
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Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki. Finding optimal pathways in chemical reaction networks using Ising machines. Physical Review Research. 2024
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Sulimon Sattari, Udoy S. Basak, Ryan G. James, Louis W. Perrin, James P. Crutchfield, Tamiki Komatsuzaki. Modes of information flow in collective cohesion. SCIENCE ADVANCES. 2022. 8. 6. eabj1720
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田畑公次, 田畑公次, 川越寛之, TALYER James Nicholas, 望月健太郎, 久保俊貴, CLEMENT Jean-Emmanuel, 熊本康昭, 熊本康昭, 原田義規, et al. バンディットラマン顕微鏡:強化学習を用いた迅速診断. 日本分光学会年次講演会(CD-ROM). 2022. 2022
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書籍 (35件)：
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Minorities and Small Numbers from Molecules to Organisms in Biology-Toward a New Understanding of Biological Phenomena
Springer 2018
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化学反応理論の普遍性:GRRMに期するもの
IQCE NEWS (量子化学探索研究所) 2018
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【少数性生物学ってなんだ?少数の因子が生命システムを制御する】少数と個性 分子の数と生命らしさ
(株)羊土社 2017
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少数性生物学
株式会社 日本評論社 2017
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Advances in Chemical Physics
Wiley 2017
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講演・口頭発表等 (422件)：
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実在分子系における化学反応動力学の相空間構造の理論的研究
(第18回分子科学討論会 2024)
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個体差を反映した薬物迅速スクリーニングと異なる種間の情報接続
(2024年度日本神経回路学会時限研究会 2024)
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Raman Imaging Algorithm for Analysing Therapy-Resistant Cancer Cells
(28th International Conference on Raman Spectroscopy - ICORS 2024 2024)
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On-the-Fly Raman Microscopy Guaranteeing the Accuracy of Discrimination
(28th International Conference on Raman Spectroscopy - ICORS 2024 2024)
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Development of;an;Efficien;Estimation Method for;Maximum Tolerated Dose by Reinforcement Learning
(IUPAB2024 2024)
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学位 (1件)：
- 博士(理学) (総合研究大学院大学(分子科学研究所))
経歴 (38件)：
- 2024/09 - 現在 FlyWorks Inc. 技術アドバイザー
- 2023/04 - 現在 情報計測オンラインセミナー運営委員会 委員
- 2022/10 - 現在 日本化学会代議員
- 2022/07 - 現在 大阪大学産業科学研究所 特任教授
- 2022/04 - 現在 学術変革領域B「嫉妬の科学」外部アドバイザー
- 2022/04 - 現在 SIAM Conference on Applications of Dynamical Systems (DS23) Organizing Committee
- 2022/04 - 現在 大阪大学 先導的学際研究機構 超次元ライフイメージング研究部門 招へい教授
- 2022/04 - 現在 生物物理学会北海道支部長
- 2021/11 - 現在 東京大学 客員共同研究員
- 2019/07 - 現在 北海道大学人間知・脳・AI研究教育センター 兼務教員
- 2018/10 - 現在 北海道大学化学反応創成研究拠点 (WPI-ICReDD) PI
- 2018/04 - 現在 北海道大学 大学院総合化学院物質化学コース 兼任 教授
- 2015/04 - 現在 北海道大学 電子科学研究所附属社会創造数学研究センター データ数理 研究分野(改組) 教授
- 2022/11 - 2023/03 情報計測オンラインセミナー運営委員会 委員長
- 2021/06 - 2022/11 情報計測オンラインセミナー運営委員会 副委員長
- 2021/10 - 2022/03 早稲田大学 先進理工学部 非常勤講師(集中講義)
- 2021/10 - 2022/03 東京大学大学院総合文化研究科 非常勤講師(集中講義)
- 2020/10 - 2021/03 東京大学大学院理学研究科化学専攻 非常勤講師 (集中講義)
- 2017/04 - 2021/03 北海道大学共同プロジェクト拠点「知識メディアラボラトリ」 運営委員
- 2007/10 - 2021/03 北海道大学 大学院生命科学院生命融合科学コース 教授 兼任
- 2019/05 - 2019/05 リヨン高等師範学校(Ecole normale supérieure de Lyon) 客員教授
- 2015/04 - 2019/03 北海道大学 電子科学研究所附属社会創造数学研究センター センター長
- 2018/11 - 2018/12 リヨン高等師範学校(Ecole normale supérieure de Lyon) 客員教授
- 2016/06 - 2016/07 ブルゴーニュ大学 CNRS-Université de Bourgogne 客員教授
- 2015/04 - 2016/03 中央大学 理工学部物理学科 非常勤講師(集中講義)
- 2008/04 - 2015/03 数学連携研究センター 教授 兼任
- 2007/10 - 2015/03 北海道大学 電子科学研究所分子生命数理研究分野 教授
- 2003/07 - 2007/09 21世紀COEプログラム「惑星系の起源と進化」兼任
- 1999/07 - 2007/09 神戸大学 大学院自然科学研究科情報メディア科学専攻 助教授併任
- 1999/07 - 2007/09 神戸大学 理学部地球惑星科学科非線形科学研究室 助教授
- 2006/04 - 2007/03 広島大学 理学部化学科 非常勤講師 (集中講義)
- 2005/04 - 2006/03 分子科学研究所理論研究系 分子基礎理論第四研究部門 客員助教授
- 2004/04 - 2005/03 茨城大学大学院理工学研究科 非常勤講師 (集中講義)
- 2003/04 - 2004/03 東京大学 教養部・大学院総合文化研究科 (集中講義) 非常勤講師
- 2001/04 - 2002/03 滋賀大学教育学部 非常勤講師
- 1998/04 - 1999/06 シカゴ大学化学科 research associate(医療保険、退職金完備)
- 1997/03 - 1998/03 シカゴ大学化学科 日本学術振興会 特別研究員(PD)
- 1994/04 - 1997/02 基礎化学研究所(現、京都大学福井謙一記念研究センター) 研究員/日本学術振興会 特別研究員(PD)
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委員歴 (25件)：
- 2024/01 - 現在 生物物理学会 分野別専門委員(非線形・カオス・複雑系)
- 2024/01 - 現在 生物物理学会 「生物物理」編集委員長
- 2023/10 - 現在 科学技術振興機構・創発アドバイザー
- 2019/06 - 現在 科学技術振興機構・さきがけ「革新的な量子情報処理技術基盤の創出」 アドバイザー
- 2018/01 - 現在 人工知能学会第2種研究会 計測インフォマティクス研究会 (Special Interest Group on Measurement Informatics: SIG-MEI) 幹事
- 2017/02 - 現在 “Scientific Reports” Division of Chemical Physics Editorial Board
- 2019/12 - 2023/12 日本生物物理学会 Biophysics Physicobiology 副編集委員長
- 2013/01 - 2023/12 “Biophysics and Physicobiology” Editorial Board
- 2023/02 - 2023/09 JST/ERATO, 選考パネルメンバー
- 2021/04 - 2023/03 分子科学研究所 学会等連絡会議構成員
- 2017/04 - 2022/03 生物物理学会北海道支部 幹事
- 2019/06 - 2021/05 日本生物物理学会 副会長
- 2009/04 - 2021/03 (財)新世代研究所「バイオ単分子研究会」 研究会委員
- 2020/08 - 2020/12 JST/創発的研究支援事業 外部専門委員
- 2019/12 - 2020/11 Biophysical Reviews, Springer Nature IUPAB Special Issue Editor
- 2019/04 - 2019/09 JST/ERATO 選考パネルメンバー
- 2018/04 - 2018/09 JST/ERATO 選考パネルメンバー
- 2017/04 - 2018/03 日本化学会北海道支部 学会賞推薦委員・学術賞等推薦委員
- 2015/06 - 2017/06 生物物理学会 理事・代議員
- 2015/04 - 2016/03 科学技術調査資料作成委託事業「数学・数理科学を活用した異分野融合研究の動向調査(代表者:国立大学法人東北大学知の創出センター)」 協力機関責任者
- 2014/03 - 2016/02 日本化学会北海道支部支部 役員(幹事)
- 2014/01 - 2015/06 生物物理学会 代議員
- 2009/04 - 2012/03 (財)国際高等研究所「諸科学の共通言語としての数学の発掘と数理科学への展開(高橋陽一郎<京都大学数理解析研究所教授>委員長)」 研究会委員
- 2007/01 - 2008/12 生物物理学会 学会誌編集委員
- 2006/01 - 2008/12 The Telluride science research center Board of directors
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受賞 (4件)：
- 2021/09 - FACSS SciX2021 Finalist of FACSS Innovation award On-the-fly Raman image microscopy by reinforcement machine learning
- 2014 - 科研費審査員表彰
- 2012 - Bulletin of the Chemical Society of Japan (BCSJ) Award
- 2010 - Human Frontier Science Program (HFSP) Grant Award
所属学会 (8件)：
American Association for the Advancement of Science
, SIAM(Society for Industrial and Applied Mathematics)
, 分子科学会
, WATOC(World Association of Theoretically Oriented Chemists)
, アメリカ化学会
, 日本物理学会
, 日本生物物理学会
, 日本化学会
