研究者
J-GLOBAL ID:200901054348497880   更新日: 2024年08月19日

清水 敏之

シミズ トシユキ | Shimizu Toshiyuki
所属機関・部署:
職名: 教授
ホームページURL (1件): http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~kouzou/
研究分野 (2件): 生物物理学 ,  構造生物化学
研究キーワード (8件): intracellular signaling ,  innate immunity ,  シグナル伝達 ,  自然免疫 ,  構造生物学 ,  X線結晶構造解析 ,  CryoEM ,  Structural Biology
競争的資金等の研究課題 (31件):
  • 2023 - 2027 自然免疫応答の起点となるリソソーム ーリソソーム環境場の重要性ー
  • 2022 - 2027 リソソームにおける自己指向性核酸認識の分子構造基盤解明
  • 2021 - 2026 Toll様受容体の応答を決定する時空間リソソームダイナミクス
  • 2021 - 2023 糖鎖を利用したクライオ電子顕微鏡解析の問題克服と自然免疫受容体TLRへの応用
  • 2019 - 2022 自然免疫センサーの動作機構と新規制御機構の解明
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論文 (181件):
  • Yoshinori Hirano, Umeharu Ohto, Ikuyo Ichi, Ryota Sato, Kensuke Miyake, Toshiyuki Shimizu. Cryo-EM analysis reveals human SID-1 transmembrane family member 1 dynamics underlying lipid hydrolytic activity. Communications biology. 2024. 7. 1. 664-664
  • Zhikuan Zhang, Takuma Shibata, Akiko Fujimura, Jiro Kitaura, Kensuke Miyake, Umeharu Ohto, Toshiyuki Shimizu. Structural basis for thioredoxin-mediated suppression of NLRP1 inflammasome. Nature. 2023. 622. 7981. 188-194
  • Honami Echizen, Kenjiro Hanaoka, Kazuhito Shimamoto, Ryota Hibi, Sachiko Toma-Fukai, Hisashi Ohno, Eita Sasaki, Toru Komatsu, Tasuku Ueno, Yukihiro Tsuchiya, et al. Discovery of a cystathionine γ-lyase (CSE) selective inhibitor targeting active-site pyridoxal 5'-phosphate (PLP) via Schiff base formation. Scientific reports. 2023. 13. 1. 16456-16456
  • Kentaro Sakaniwa, Akiko Fujimura, Takuma Shibata, Hideki Shigematsu, Toru Ekimoto, Masaki Yamamoto, Mitsunori Ikeguchi, Kensuke Miyake, Umeharu Ohto, Toshiyuki Shimizu. TLR3 forms a laterally aligned multimeric complex along double-stranded RNA for efficient signal transduction. Nature Communications. 2023. 14. 1
  • Sachiko Toma-Fukai, Yuto Sawada, Ayako Maeda, Hikaru Shimizu, Toshiharu Shikanai, Mizuki Takenaka, Toshiyuki Shimizu. Structural insight into the activation of an Arabidopsis organellar C-to-U RNA editing enzyme by active site complementation. The Plant cell. 2022
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MISC (90件):
  • 藤間祥子, 藤間祥子, 澤田優斗, 前田彩子, 清水光, 鹿内利治, 竹中瑞樹, 清水敏之. 植物オルガネラC-to-U RNA編集酵素DYW1の結晶構造解析. 日本結晶学会年会講演要旨集. 2023. 2023
  • 竹中瑞樹, 藤間祥子, BRODY Frink, WANG Tenghua, 竹中佐知, 鹿内利治, 清水敏之. 植物オルガネラのRNA編集酵素が複合体形成によって活性化される機構. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
  • 藤間祥子, 中村雄太郎, 寺谷俊昭, 川本晃大, 清水光, 廣瀬未果, 端山浩輝, 大畑慎也, 林有吾, 山崎洋一, et al. PPARg核内輸送機構の構造生物学的研究. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
  • 藤間祥子, 藤間祥子, 澤田優斗, 前田彩子, 清水光, 鹿内利治, 竹中瑞樹, 清水敏之. 植物オルガネラC-to-U RNA編集酵素DYW-1の構造生物研究. 量子ビームサイエンスフェスタ(Web). 2022. 2021
  • 藤間祥子, 端山浩輝, 松浦滉明, 坂井直樹, 平田邦生, 松谷優輝, 清水光, 大畑慎也, 林有吾, 山崎洋一, et al. 強度クラスタリング法を利用した蛋白質複合体の結晶内構造多型の同定. 日本結晶学会年会講演要旨集. 2020. 2020 (CD-ROM)
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学歴 (2件):
  • - 1989 東京大学 薬学系研究科
  • - 1987 東京大学 薬学部
学位 (1件):
  • 博士(薬学)
経歴 (7件):
  • 2010/05 - 現在 東京大学大学院薬学系研究科 蛋白構造生物学教室 教授
  • 2009/04 - 2010/04 横浜市立大学 生命ナノシステム科学研究科 准教授
  • 2005/04 - 2009/03 横浜市立大学 国際総合科学研究科 準教授
  • 2001/04 - 2005/03 横浜市立大学 総合理学研究科 助教授
  • 1995 - 2001 奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科 助手
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受賞 (1件):
  • 2007 - 薬学研究ビジョン部会賞
所属学会 (4件):
日本結晶学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本生化学会 ,  日本薬学会
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