柚木克之

ユギカツユキ | Yugi Katsuyuki

所属機関・部署：
職名：チームリーダー
その他の所属（所属・部署名・職名） (2件)：

ホームページURL (1件)： https://www.riken.jp/research/labs/ims/integr_cell_sys/

研究分野 (2件)：システムゲノム科学 , 生命、健康、医療情報学

研究キーワード (4件)：数理モデル , システム生物学 , 代謝 , トランスオミクス

競争的資金等の研究課題 (9件)：

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論文 (39件)：

Yunfan Bai, Keigo Morita, Toshiya Kokaji, Atsushi Hatano, Satoshi Ohno, Riku Egami, Yifei Pan, Dongzi Li, Katsuyuki Yugi, Saori Uematsu, et al. Trans-omic analysis reveals opposite metabolic dysregulation between feeding and fasting in liver associated with obesity. iScience. 2024. 27. 3. 109121-109121
Kozo Nishida, Junichi Maruyama, Kazunari Kaizu, Koichi Takahashi, Katsuyuki Yugi. Transomics2cytoscape: an automated software for interpretable 2.5-dimensional visualization of trans-omic networks. NPJ systems biology and applications. 2024. 10. 1. 16-16
Tadashi Takeuchi, Tetsuya Kubota, Yumiko Nakanishi, Hiroshi Tsugawa, Wataru Suda, Andrew Tae-Jun Kwon, Junshi Yazaki, Kazutaka Ikeda, Shino Nemoto, Yoshiki Mochizuki, et al. Gut microbial carbohydrate metabolism contributes to insulin resistance. Nature. 2023. 621. 7978. 389-395
Toshiya Kokaji, Miki Eto, Atsushi Hatano, Katsuyuki Yugi, Keigo Morita, Satoshi Ohno, Masashi Fujii, Ken-Ichi Hironaka, Yuki Ito, Riku Egami, et al. In vivo transomic analyses of glucose-responsive metabolism in skeletal muscle reveal core differences between the healthy and obese states. Scientific reports. 2022. 12. 1. 13719-13719
Akira Terakawa, Yanhui Hu, Toshiya Kokaji, Katsuyuki Yugi, Keigo Morita, Satoshi Ohno, Yifei Pan, Yunfan Bai, Andrey A. Parkhitko, Xiaochun Ni, et al. Trans-omics analysis of insulin action reveals a cell growth subnetwork which co-regulates anabolic processes. iScience. 2022. 25. 5. 104231-104231

MISC (8件)：

小鍛治俊也, 幡野敦, 柚木克之, 黒田真也. 【マルチオミクスを使って得られた最新知見糖尿病・がん・腸内細菌研究における実例と解析法】マウス肝臓における肥満特異的な代謝制御トランスオミクスネットワーク構築. 実験医学. 2020. 38. 8. 1289-1294
Katsuyuki Yugi, Satoshi Ohno, James R. Krycer, David E. James, Shinya Kuroda. Rate-oriented trans-omics: integration of multiple omic data on the basis of reaction kinetics. Current Opinion in Systems Biology. 2019. 15. 109-120
Katsuyuki Yugi, Shinya Kuroda. Metabolism as a signal generator across trans-omic networks at distinct time scales. Current Opinion in Systems Biology. 2018. 8. 59-66
柚木克之, Krycer James R, 平山明由, Fazakerley Daniel J, Quek Lake-Ee, Scalzo Richard, 大野聡, Hodson Mark P, 池田五月, 庄司二葉, et al. 動的13C-メタボロミクスおよびリン酸化プロテオミクスの統合解析により明らかとなった脂肪細胞の代謝プライミング機構. JSBMS Letters. 2017. 42. Suppl. 108-108
柚木克之, 久保田浩行, 黒田真也. トランスオミクス解析 : マルチオミクスデータから代謝制御ネットワークを再構築する. バイオサイエンスとインダストリー. 2015. 73. 5. 392-394

特許 (1件)：

書籍 (1件)：

講演・口頭発表等 (6件)：

健常および肥満マウスの肝臓および筋肉におけるグルコース負荷に対する代謝変動の網羅的解析
(日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 2015)
インスリン作用のトランスオミクス解析
(日本プロテオーム学会大会要旨集 2014)
RNA-Seqを用いたインスリン依存的選択的スプライシング変動の網羅的解析
(日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 2013)
Kinetic Modelling of Energy Metabolism in Mitochondria
(Genome Informatics 1999)
E-CELLプロジェクトの概要細胞内全代謝の包括的シミュレーションに向けて
(日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 1998)

学位 (1件)：

経歴 (7件)：

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委員歴 (6件)：

2024 - ECCB2024 (23st European Conference on Computational Biology) プログラム委員会・査読者
2022 - ECCB2022 (21st European Conference on Computational Biology) プログラム委員会・査読者
2019/01 - 2019/12 日本分子生物学会第42回年会ポスター編成委員
2018/11 - 2019/11 日本分子生物学会第41回日本分子生物学会年会ポスターディスカッサー
2018/04 - 2019/11 International Conference on Systems Biology 2019 Organizing committee core member

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受賞 (1件)：

所属学会 (5件)：

日本薬理学会 , 日本プロテオーム学会 , 日本神経科学学会 , International Society for Systems Biology , 日本分子生物学会

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柚木 克之