李秀栄

リスヨン | Re Suyong

所属機関・部署：
職名：プロジェクトリーダー
ホームページURL (1件)： https://mizuguchilab.org

研究分野 (3件)：基礎物理化学 , 生物物理学 , 生命、健康、医療情報学

研究キーワード (1件)：分子シミュレーション、生体分子認識、構造ベース創薬

競争的資金等の研究課題 (17件)：

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論文 (72件)：

Piotr Chyży, Marta Kulik, Ai Shinobu, Suyong Re, Yuji Sugita, Joanna Trylska. Molecular dynamics in multidimensional space explains how mutations affect the association path of neomycin to a riboswitch. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2024. 121. 15
Yulong Gou, Suyong Re, Kenji Mizuguchi, Chioko Nagao. Impact of Hydrogen Bonding on P-Glycoprotein Efflux Transport as Revealed by Evaluation of a De Novo Prediction Model. ACS Medicinal Chemistry Letters. 2023
Yosui Nojima, Masahiko Aoki, Suyong Re, Hidekazu Hirano, Yuichi Abe, Ryohei Narumi, Satoshi Muraoka, Hirokazu Shoji, Kazufumi Honda, Takeshi Tomonaga, et al. Integration of pharmacoproteomic and computational approaches reveals the cellular signal transduction pathways affected by apatinib in gastric cancer cell lines. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2023. 21. 2172-2187
Yoshinobu Igarashi, Suyong Re, Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno, Hiroshi Yamada. Development of a GCN-based model to predict <i>in vitro</i> phototoxicity from the chemical structure and HOMO-LUMO gap. The Journal of Toxicological Sciences. 2023. 48. 5. 243-249
Yuhi Hosoe, Yohei Miyanoiri, Suyong Re, Saki Ochi, Yuya Asahina, Toru Kawakami, Masataka Kuroda, Kenji Mizuguchi, Masayuki Oda. Structural dynamics of the N-terminal SH2 domain of PI3K in its free and CD28-bound states. The FEBS Journal. 2022. 290. 9. 2366-2378

MISC (29件)：

森脇由隆, 大上雅史, 岡野原大輔, 田口英樹, 白水美香子, 新津藍, 李秀栄, 神谷由紀子. 緊急特集 AlphaFold3:その正体を探る. 現代化学. 2024. 640. 17-22
李秀栄. 「連結シミュレーション」による分子標的薬「イマチニブ」のタンパク質結合経路の予測. CBI学会誌. 2023. 11. 3. 3-4
李秀栄. 糖鎖の分子動力学シミュレーション. GlycoWord. 2023
Hisham M. Dokainish, Suyong Re, Takaharu Mori, Chigusa Kobayashi, Jaewoon Jung, Yuji Sugita. Unraveling SARS-CoV-2 spike protein activation pathway reveals unprecedented cryptic pockets. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2022. 121. 3. 457A-457A
李秀栄, DOKAINISH Hisham M, 森貴治, 小林千草, JUNG Jaewoon, 杉田有治. 「富岳」を用いた SARS-CoV-2 受容体結合ドメインの動的構造解析. アンサンブル. 2022. 24. 1. 7-14

書籍 (2件)：

創薬研究のための相互作用解析パーフェクト : 低中分子・抗体創薬におけるスクリーニング戦略と実例、in silico解析、一歩進んだ分析技術まで
羊土社 2021 ISBN:9784758122566
Replica Exchange Methods for Biomolecular Simulation. In: Bonomi M., Camilloni C. (eds) Biomolecular Simulations. Methods in Molecular Biology
Humana Press, New York, NY 2019 ISBN:9781493996070

講演・口頭発表等 (67件)：

Structure and stability of glycan interaction network on the HIV envelope glycoprotein
(CBI学会2024年大会 2024)
糖鎖シールド環境における糖鎖-抗体結合の自由エネルギー解析
(第11回「富岳」を中核とするHPCIシステム利用研究課題成果報告会 2024)
Integrated informatics and molecular simulation for modeling antibody epitopes on viral envelope glycoproteins
(1st Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference (APBJC2024) 2024)
HIVエンベープ糖タンパク質の糖鎖ネットワーク解析
(第43回日本糖質学会年会 2024)
Impact of glycan shielding on antibody epitopes on viral envelope proteins revealed by molecular dynamics simulations
(21st IUPAB and 62nd BSJ Joint Congress 2024 (IUPAB2024) 2024)

学歴 (5件)：

学位 (1件)：

経歴 (13件)：

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受賞 (4件)：

所属学会 (4件)：

日本糖質学会 , 日本生物物理学会 , 日本化学会 , 情報計算化学生物学会(CBI学会)

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李 秀栄