笹井理生

ササイマサキ | Sasai Masaki

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： http://www.tbp.cse.nagoya-u.ac.jp/

研究分野 (1件)：生物物理、化学物理、ソフトマターの物理

研究キーワード (9件)：計算機シミュレーション , 統計力学 , 確率過程 , 染色体構造 , 遺伝子ネットワーク , 遺伝子スイッチ , 分子モーター , アロステリック転移 , 蛋白質フォールディング

競争的資金等の研究課題 (36件)：

2022 - 2027 ゲノム動態の原理とDNA機能
2021 - 2023 4Dゲノムアーキテクチャと細胞の転写活性
2020 - 2022 タンパク質概日リズム振動の情報物理学
2019 - 2022 ゲノム物理学-ゲノムの立体構造形成と運動の原理
2019 - 2021 相分離による分子液滴クラスター形成とクロマチン相互作用

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論文 (194件)：

Tadasu Nozaki, Soya Shinkai, Satoru Ide, Koichi Higashi, Sachiko Tamura, Masa A Shimazoe, Masaki Nakagawa, Yutaka Suzuki, Yasushi Okada, Masaki Sasai, et al. Condensed but liquid-like domain organization of active chromatin regions in living human cells. Science advances. 2023. 9. 14. eadf1488
Takumi Nishina, Megumi Nakajima, Masaki Sasai, George Chikenji. The Structural Rule Distinguishing a Superfold: A Case Study of Ferredoxin Fold and the Reverse Ferredoxin Fold. Molecules. 2022. 27. 11. 3547-3547
Shin Fujishiro, Masaki Sasai. Generation of dynamic three-dimensional genome structure through phase separation of chromatin. Proc Natl Acad Sci USA. 2022. 119. 22. e2109838119
Masaki Sasai. Role of the reaction-structure coupling in temperature compensation of the KaiABC circadian rhythm. bioRxiv. 2021
Masaki Sasai. Mechanism of autonomous synchronization of the circadian KaiABC rhythm. Scientific Reports. 2021. 11. 1. 4713

MISC (141件)：

Sumita Das, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai. Single-molecular and ensemble-level oscillations of cyanobacterial circadian clock. Biophysics and Physicobiology. 2018. 15. 136-150
Sumita Das, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai. Role of ATP Hydrolysis in Cyanobacterial Circadian Oscillator. SCIENTIFIC REPORTS. 2017. 7
Masaki Sasai, George Chikenji, Tomoki P. Terada. Cooperativity and modularity in protein folding. Biophysics and Physicobiology. 2016. 13. 281-293-293
Tatsuya Okuno, Koya Kato, Shintaro Minami, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai, George Chikenji. Importance of consensus region of multiple-ligand templates in a virtual screening method. Biophysics and Physicobiology. 2016. 13. 149-156-156
笹井理生, 寺田智樹. 真核細胞のルースな遺伝子制御とクロマチン動態. 生物物理. 2016. 56. 2. 106-108

書籍 (17件)：

タンパク質の時間と通信と自由エネルギー
丸善出版 2022
遺伝子スイッチのダイナミクス
丸善出版 2020
Modeling of genomes, Chapter 9 in Coarse-Grained Modeling of Biomolecules
CRC Press Taylor & Francis Group 2017
生体分子のつくるシステム
共立出版 2013 ISBN:9784320122727
論文にみる最重要概念と革新実験データその3
化学同人 2012

講演・口頭発表等 (33件)：

The role of dynamic cohesin looping in chromatin compaction and phase separation
(The 30th Hot Spring Harbor International Symposium 2022)
Stochastic dynamics of transcription and chromatin movement
(International Center for Theoretical Science Symposium 2020)
Protein Clock: How Chemical Free Energy is Used for Synchronization
(14th Asia-Pacific Physics Conference 2019)
The phase-separation principle of human genome folding
(CSRC Workshop on DNA Chromosome Structure and Dynamics 2017)
Role of Dynamical DNA Methylation in Gene Regulation
(International Conference on Biological Physics 2017 2017)

学歴 (1件)：

- 1985 京都大学理学研究科物理学第一

学位 (2件)：

理学博士 (京都大学)
Dr. Sci (Kyoto University)

経歴 (24件)：

2022/06 - 現在京都大学福井謙一記念研究センター研究員
2022/04 - 現在名古屋大学名誉教授
2022/04 - 2023/03 名古屋大学大学院情報学研究科招へい教員
2017/04 - 2022/03 名古屋大学大学院工学研究科応用物理学専攻複合系物性工学教授
2017/04/01 - 2018/03/31 名古屋大学工学部・工学研究科物理工学科長

2017/04/01 - 2018/03/31 名古屋大学大学院工学研究科応用物理学専攻専攻長

2017/04/01 - 2018/03/31 名古屋大学大学院工学研究科工学部・工学研究科物理工学科長

2011/04/01 - 2017/03/31 名古屋大学大学院工学研究科計算理工学専攻教授

2011/04/01 - 2017/03/31 名古屋大学大学院工学研究科計算理工学専攻教授大学院工学研究科計算理工学専攻応用計算科学教授

2014/04/01 - 2015/03/31 名古屋大学大学院工学研究科計算理工学専攻専攻長

2012/04/01 - 2014/03/31 名古屋大学大学院工学研究科附属計算科学連携教育研究センターセンター長

2011/04/01 - 2013/03/31 名古屋大学附属図書館商議員

2009/04/01 - 2011/03/31 名古屋大学大学院工学研究科マテリアル理工学専攻応用物理学分野

2009/04/01 - 2011/03/31 名古屋大学大学院工学研究科マテリアル理工学専攻応用物理学分野大学院工学研究科マテリアル理工学専攻教授

2006/04/01 - 2009/03/31 名古屋大学大学院工学研究科計算理工学専攻教授

2006/04/01 - 2009/03/31 名古屋大学大学院工学研究科計算理工学専攻教授大学院工学研究科計算理工学専攻教授

2003/04/01 - 2006/03/31 名古屋大学大学院情報科学研究科複雑系科学専攻教授

2006/03/31 - 名古屋大学大学院情報科学研究科複雑系科学専攻教授

2003/10 - 2006/03 名古屋大学高等研究院教授

1998/04/01 - 2003/03/31 名古屋大学大学院人間情報学研究科物質・生命情報学専攻教授

1992/04/01 - 1998/03/31 名古屋大学大学院人間情報学研究科物質・生命情報学専攻助教授

1991/04/01 - 1992/03/31 名古屋大学教養部化学教室助教授教授

1991/04/01 - 1992/03/31 名古屋大学教養部化学教室助教授

1985/08 - 1991/03/31 岡崎国立共同研究機構分子科学研究所理論研究系助手

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委員歴 (12件)：

2022/01 - 2024/12 国際純粋及び応用物理学連合 Biological Physics委員会議長
2017/10 - 2023/09 日本学術会議連携会員
2019/06 - 2021/05 日本生物物理学会監事
2018/01 - 2020/12 国際純粋及び応用物理学連合(IUPAP) Biological Physics Commission Seceretary
2017/12 - 2019/07 ICBP2019-EBSA joint conference Science Advisory Committee 委員

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所属学会 (4件)：

Biophysical Society , 日本蛋白質科学会 , 日本物理学会 , 日本生物物理学会

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