- 2021 - 2024 比較トランスクリプトーム解析に基づいたエンマコオロギの卵休眠機構の解明
- 2019 - 2024 生物界に存在する発光タンパク質の進化と発光機構のインベントリー創出
- 2018 - 2023 SLE関連多型に触発された構造モジュール組換えによる抗原受容体活性化機構の解明
- 2017 - 2020 細胞生物学および計算生物学の手法を用いた消毒機構の定量的評価に関する研究
- 2015 - 2018 ヒトORCのグアニン四重鎖結合活性の複製開始点形成における役割の解明
- 2013 - 2016 RNA・タンパク質相互作用の網羅的予測と検証
- 2008 - 2010 新規ドーパリガンドの構造決定とドーパ応答の電気生理学的解析
- 2007 - 2009 DNA修復促進タンパク質のDNA鎖切断部位への結合様式の解明
- 2006 - 2009 選択的スプライシングを受けたタンパク質の立体構造モデリングによる機能解析
- 2007 - 2008 生体高分子間相互作用構造推定のため情報抽出法の開発
- 2005 - 2007 低分解能生体分子像からの原子構造構築技法
- 2004 - 2006 ダイナミックスと進化情報の融合によるDNA修復関連タンパク質の機能アノテーション
- 2004 - 2004 タンパク質の多様性獲得戦略の解明に基づいたゲノム情報の解読
- 2004 - 2004 遺伝子同時転写単位同定にもとづく新規DNA修復関連タンパク質の予測
- 2000 - 2004 タンパク質立体構造情報からのゲノム機能解読・進化の解析
- 2003 - 2003 進化情報を用いたDNA修復酵素複合体の相互作用部位予測
- 2002 - 2002 全ゲノム配列比較にもとづくDNA修復酵素の比較と分類
- 2001 - 2002 モジュール3Dキーノートを用いたゲノム機能予測法の開発
- 1999 - 2002 モジュール知識に基づくタンパク質機能予測法の開発
- 1999 - 2002 タンパク質の機能とモジュールシャッフリング
- 2002 - DNA損傷修復関連タンパク質の構造と機能
- 2001 - ゲノムからの蛋白質 構造 機能予測
- 1999 - 2000 金属イオン結合モジュールの金属配位様式の共通性・多様性
- 1995 - 1999 タンパク質立体構造の比較・予測・デザイン
- 1997 - 1998 リン酸基結合モジュールにもとづくDNA結合部位の推定
- 1996 - 1998 タンパク質モジュールとエクソンとの対応の普遍性
- 1997 - 1997 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
- 1996 - 1997 蛋白質の可溶化のためのデザイン手法の開発
- 1996 - 1996 DNAリン酸基に結合するモジュールは共通か
- 1996 - 1996 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
- 1995 - 1995 リン酸を結合する複数のタンパク質に存在する共通のモジュール
- 1995 - 1995 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
- 1994 - 1995 タンパク質モジュールの分類
- 1994 - 1994 シトクロムP-450camとCamリプレッサーとの共通構造
- 1994 - 1994 転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識
- 1990 - 蛋白質分子の構造, 機能及び進化
- Structure, function and evolution of protein
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