冨樫祐一

トガシユウイチ | TOGASHI YUICHI

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

理化学研究所生命機能科学研究センター客員主管研究員

ホームページURL (1件)： http://www.togashi.tv/lab/

研究分野 (1件)：生物物理、化学物理、ソフトマターの物理

競争的資金等の研究課題 (12件)：

2023 - 2029 non-AUG翻訳:「ゆらぎ」翻訳開始機構による疾病発症機構の解明
2021 - 2025 細胞内の高分子混雑環境における伝熱と分子構造
2019 - 2021 シンギュラリティ細胞が率いる集団を表現する機械論的モデルの構成
2018 - 2021 形ある生体高分子間の力学的な情報伝達・相互干渉の数理
2018 - 2020 染色体3次元構造理論の構築と応用:深層学習を援用した染色体4Dシミュレーション

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論文 (51件)：

Radek Erban, Yuichi Togashi. Asymmetric Periodic Boundary Conditions for All-Atom Molecular Dynamics and Coarse-Grained Simulations of Nucleic Acids. Journal of Physical Chemistry B. 2023. 127. 38. 8257-8267
Takeru Kameda, Akinori Awazu, Yuichi Togashi. Molecular dynamics analysis of biomolecular systems including nucleic acids. Biophysics and Physicobiology. 2022. 19. e190027
Yoshihiko Fujita, Takeru Kameda, Chingakham Ranjit Singh, Whitney Pepper, Ariana Cecil, Madelyn Hilgers, Mackenzie Thornton, Izumi Asano, Carter Moravek, Yuichi Togashi, et al. Translational recoding by chemical modification of non-AUG start codon ribonucleotide bases. Science Advances. 2022. 8. 14. eabm8501
Yuichi Togashi. Multiscale Modeling of Chromatin Considering the State and Shape of Molecules. Lecture Notes in Mechanical Engineering. 2022. 171-175
Takeru Kameda, Katsura Asano, Yuichi Togashi. Free energy landscape of RNA binding dynamics in start codon recognition by eukaryotic ribosomal pre-initiation complex. PLoS Computational Biology. 2021. 17. 6. e1009068

MISC (2件)：

冨樫祐一. 書評 CELL BIOLOGY by the numbers. 生物物理. 2016. 56. 6. 352-352
冨樫祐一. 書評エントロピーからはじめる熱力学. 生物物理. 2016. 56. 4. 246-246

特許 (1件)：

Gタンパク質共役型受容体(GPCR)の活性評価方法

書籍 (4件)：

Minorities and Small Numbers from Molecules to Organisms in Biology: Toward a New Understanding of Biological Phenomena
Springer Singapore 2018 ISBN:9789811320828
少数性生物学
日本評論社 2017 ISBN:9784535788169
Engineering of Chemical Complexity
World Scientific Publishing 2013
バイオナノプロセス-溶液中でナノ構造を作るウェット・ナノテクノロジーの勧め-
シーエムシー出版 2008

学歴 (2件)：

1998 - 2004 東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻相関基礎科学系
1994 - 1998 東京大学教養学部理科一類/基礎科学科第一

学位 (2件)：

博士(学術) (東京大学)
修士(学術) (東京大学)

経歴 (17件)：

2021/04 - 現在理化学研究所生命機能科学研究センター客員主管研究員
2021/04 - 現在立命館大学生命科学部生命情報学科教授
2011/04 - 2022/03 大阪大学サイバーメディアセンター招へい教員
2019/04 - 2021/03 広島大学大学院統合生命科学研究科准教授
2018/11 - 2021/03 理化学研究所生命機能科学研究センター上級研究員

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委員歴 (12件)：

2024/01 - 現在日本生物物理学会 Biophysics and Physicobiology 編集委員
2024/01 - 現在日本生物物理学会会誌副編集委員長
2023/06 - 現在日本生物物理学会代議員
2022/06 - 2024/06 日本科学振興協会理事
2022/01 - 2022/12 日本生物物理学会分野別専門委員(分野:数理モデル・数理生物学)

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所属学会 (9件)：

研究・イノベーション学会 , 日本科学振興協会 , システム制御情報学会 , Institute of Electrical and Electronics Engineers , The Biophysical Society , 日本分子生物学会 , 人工知能学会 , 日本生物物理学会 , 日本物理学会

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