山乙教之

ヤマオツノリユキ | Yamaotsu Noriyuki

所属機関・部署：
職名：准教授
ホームページURL (2件)： https://www.pharm.kitasato-u.ac.jp/souyaku/Welcome.html , https://www.pharm.kitasato-u.ac.jp/souyaku/e_home1.html

研究分野 (3件)：薬系化学、創薬科学 , 薬系分析、物理化学 , 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理

研究キーワード (4件)：分子動力学 , in silico スクリーニング , 分子動力学 , in silico Screening

競争的資金等の研究課題 (18件)：

2015 - 2018 創薬効率を高めるための計算機的フラグメントベース・ドラッグデザイン手法の開発
2010 - 2012 架橋水をリガンドに組み込んだ仮想的水和リガンドドッキング法の開発
2009 - 2011 新規抗ガン剤の創製を目指したCRK-C3G相互作用阻害剤のイン・シリコ分子設計
2009 - 2011 計算創薬技術を用いたマクロライド骨格を持つ新規キチナーゼ阻害剤の構造最適化
2007 - 2008 In silico創薬技術を用いた新規キチナーゼ阻害剤の分子設計

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論文 (60件)：

Miyuki Konya, Shiho Arima, Daiki Lee, Masaki Ohtawa, Kenta Shimoyama, Takashi Fukuda, Ryuji Uchida, Hiroshi Tomoda, Noriyuki Yamaotsu, Nobutada Tanaka, et al. Synthesis and Evaluation of Habiterpenol Analogs. Chemical and Pharmaceutical Bulletin. 2022. 70. 4. 261-268
Kensuke Misawa, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono. Identification of novel EED-EZH2 PPI inhibitors using an in silico fragment mapping method. Journal of Computer-Aided Molecular Design. 2021. 35. 5. 601-611
Ozawa S, Takahashi M, Yamaotsu N, Hirono S. Structure-based virtual screening for novel chymase inhibitors by in silico fragment mapping. J. Mol. Graph. Model. 2019. 89. 102-108
Misawa K, Ozawa S, Yoshida T, Nakagome I, Yamaotsu N, Hirono S. Identifying inhibitors of USP7-HDM2 protein-protein interaction (PPI) by the in silico fragment-mapping method. Yakugaku Zasshi. 2019. 139. 5. 827-835
K. Kato, K. Fujii, T. Nakayoshi, Y. Watanabe, S. Fukuyoshi, K. Ohta, Y. Endo, N. Yamaotsu, S. Hirono, E. Kurimoto, et al. Structural differences between the ligand-binding pockets of estrogen receptors alpha and beta. Journal of Physics: Conference Series. 2018. 1136. 1

MISC (39件)：

渡邉友里江, 福吉修一, 伊藤雅, 平塚真弘, 山乙教之, 広野修一, 小田彰史, 小田彰史. 分子動力学シミュレーションを用いた野生型・変異型CYP1A2の立体構造および構造柔軟性の予測. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2014. 42nd
渡邉友里江, 福吉修一, 伊藤雅, 平塚真弘, 山乙教之, 広野修一, 小田彰史, 小田彰史. 分子動力学シミュレーションを用いた野生型・変異型CYP1A2の立体構造および構造柔軟性の予測. 日本薬学会北陸支部総会及び例会プログラム・講演要旨集. 2014. 126th
A. Oda, N. Yamaotsu, S. Hirono, Y. Takano, S. Fukuyoshi, R. Nakagaki, O. Takahashi. Evaluations of the conformational search accuracy of CAMDAS using experimental three-dimensional structures of protein-ligand complexes. Journal of Physics: Conference Series. 2013. 454. 1
Yoshimi Ohashi, Hiroshi Iijima, Noriyuki Yamaotsu, Kanami Yamazaki, Shigeo Sato, Mutsumi Okamura, Kenji Sugimoto, Shingo Dan, Shuichi Hirono, Takao Yamori. Identification of a new inhibitor of the Golgi system, targeting ADP-ribosylation Factor 1 (Arf1) with potential for cancer therapy. CANCER RESEARCH. 2012. 72
中込泉, 豊岡尚樹, 峰平大輔, 竹田大輔, 加藤敦, 足立伊左雄, 松谷裕二, 川田耕司, 佐藤謙一, 山乙教之, et al. PPARγLBDと三環系PPARγパーシャルアゴニストの相互作用解析. 日本薬学会年会要旨集. 2012. 132年会. 4. 160-160

書籍 (6件)：

(Ed. Nagase H) Chemistry of Opioids
Springer-Verlag 2011
(Ed. Gundertofte K, Jorgensen FS) Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity
Kluwer Academic/Plenum Publishers 2000
Analysis of Affinities of Penicillins for a Class C β-Lactamase by Molecular Dynamics Simulations(共著)
Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity, Kluwer Academic/Plenum Publishers 2000
Analysis of Affinities of Penicillins for a Class C beta-Lactamase by Molecular Dynamics Simulations
Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity, Kluwer Academic/Plenum Publishers 2000
The Folding Simulation of α-Conotoxin MI Using Molecular Dynamics(共著)
Peptide Chemistry 1996, Protein Research Foundation 1997

講演・口頭発表等 (161件)：

μ-オピオイド受容体アロステリックリガンドBMS-986122の結合様式の同定
(日本薬学会第143年会 2023)
ポンペ病原因酵素リソソーム酸性α-グルコシダーゼに対する低分子シャペロン5-C-alkyl-L-ido-DNJのアルキル鎖長が活性や結合配向に及ぼす影響
(日本薬学会第143年会 2023)
バーチャルスクリーニングのための既知フラグメント化合物-結合サイトデータベースの構築
(第50回構造活性相関シンポジウム 2022)
In silico フラグメントマッピング法を利用したマラリア原虫の酵素pfDXRに対する新規阻害剤の探索
(日本薬学会第142年会 2022)
アロステリック・サイトは正に荷電したアミノ酸残基を好む
(日本薬学会第142年会 2022)

Works (3件)：

北里大学薬学部薬学部ニュース[No.4] 平成24年度昇任教員のあいさつ
山乙教之 2012 -
DNA分子とたんぱく質の計算機構造生物学の研究
1997 - 1999
Computational Structural Biology for DNA and Protein
1997 - 1999

学位 (1件)：

博士(薬学) (北海道大学)

経歴 (4件)：

2022/04 - 現在准教授
2012/04 - 2022/03 講師
2007/04 - 2012/03/31 助教
1990/09 - 2007/03 助手

委員歴 (2件)：

1999 - 2001 日本薬学会ファルマシアトピックス小委員
1999 - 2001 The Pharmaceutical Society of Japan Topics subcommittee of Farumashia

受賞 (6件)：

2004/07 - CBI学会2004年大会ポスター優秀賞
2004 - CBI学会2004年大会ポスター優秀賞
2003/11 - 第31回構造活性相関シンポジウムポスター賞
2003 - 第31回構造活性相関シンポジウムポスター賞
2002/09 - 第3回CBI学会大会優秀論文賞(CBI学会2002年大会ポスター優秀賞)

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所属学会 (8件)：

日本薬物動態学会 , 情報計算化学生物学会(CBI学会) , CBI学会 , 日本生物物理学会 , 日本薬学会 , Chem-Bio Informatics Society , 日本生物物理学会 , 日本薬学会

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