- 2020 - 2024 寺院史料の調査と個別的動向の解明に立脚した近世宗教政策像の更新
- 2018 - 2023 日本近世思想史の見直しと国際共同研究の試み
- 2018 - 2023 近世日本における諸国東照宮と「神格化」の研究
- 2018 - 2023 アーカイブズとしての書籍-書籍史料を次世代に伝えるために-
- 2019 - 2022 江戸の神秘思想-聖徳太子をめぐる秘伝-
- 2019 - 2022 寺院・仏堂を守護する神の展開・変容についての総合的研究-アジア仏教史の視座から-
- 2013 - 2018 多分野複合の視角から見た日本仏教の国際的研究
- 2014 - 2017 日本近世の神仏習合思想とその展開
- 2013 - 2017 日本語学習者を対象とする文語文読解教育の実態調査および教材開発
- 2011 - 2016 「書物・出版と社会変容」研究の深化と一般化のために
- 2011 - 2013 近世仏教を見直す-天台宗を中心に-
- 2009 - 2012 東照宮祭祀の確立と展開
- 2008 - 2010 「書物・出版と社会変容」研究の総合化に向けて
- 2008 - 2010 日本における本覚思想の展開-中世後期の天台宗談義所寺院を中心に-
- 2006 - 2008 東照宮祭祀の基盤・確立・展開
- 2003 - 2005 中世法会をめぐる学問とそれを表白する言説に関する基礎的研究
- 2002 - 2005 中世談義所寺院の知的交流と言説形成
- 2000 - 2001 奥羽諸藩の東照宮信仰と宗教思想
- 1998 - 1999 近世における仏教治国論の史料的研究
- 1997 - 1998 東北地方における東照宮祭祀と民間信仰
- 1994 - 1994 日本近世の仏教思想における正統と異端の研究
- 1993 - 1993 徳川家康神格化の研究
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