内山郁夫

ウチヤマイクオ | Uchiyama Ikuo

所属機関・部署：
職名：准教授

研究分野 (1件)：生物物理学

競争的資金等の研究課題 (21件)：

2023 - 2026 種内数千ゲノム比較によるピンポイント適応変異数千の検出
2021 - 2026 ジオラマ・パノラマ環境下における有害赤潮藻の集積アルゴリズムの解明
2020 - 2023 実用モデル珪藻の光環境応答・適応機構の最適化
2018 - 2021 ヘテロカプサ赤潮はなぜ貝類のみをへい死させるか-不安定毒素の全容解明への挑戦-
2017 - 2020 比較ゲノム解析に基づく水平伝搬による原核生物ゲノム進化の包括的解析

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論文 (89件)：

Kaisa Thorell, Zilia Y. Muñoz-Ramírez, Difei Wang, Santiago Sandoval-Motta, Rajiv Boscolo Agostini, Silvia Ghirotto, Roberto C. Torres, Judith Romero-Gallo, Uma Krishna, Richard M. Peek, et al. The Helicobacter pylori Genome Project: insights into H. pylori population structure from analysis of a worldwide collection of complete genomes. Nature Communications. 2023. 14. 1
Minoru Kumazawa, Hiroyo Nishide, Ryo Nagao, Natsuko Inoue-Kashino, Jian-Ren Shen, Takeshi Nakano, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Kentaro Ifuku. Molecular phylogeny of fucoxanthin-chlorophyll a / c proteins from Chaetoceros gracilis and Lhcq/Lhcf diversity. Physiologia Plantarum. 2022. 174. 1
Okubo, T., Toyoda, A., Fukuhara, K., Uchiyama, I., Harigaya, Y., Kuroiwa, M., Suzuki, T., Murakami, Y., Suwa, Y., Takami, H. The physiological potential of anammox bacteria as revealed by their core genome structure. DNA Research. 2021. 28. 1
Linard, B., Ebersberger, I., McGlynn, S.E., Glover, N., Mochizuki, T., Patricio, M., Lecompte, O., Nevers, Y., Thomas, P.D., Gabaldón, T., et al. Ten Years of Collaborative Progress in the Quest for Orthologs. Molecular Biology and Evolution. 2021. 38. 8. 3033-3045
Midori Iida, Miyuki Suzuki, Yuto Sakane, Hiroyo Nishide, Ikuo Uchiyama, Takashi Yamamoto, Ken-Ichi T Suzuki, Satoshi Fujii. A simple and practical workflow for genotyping of CRISPR-Cas9-based knockout phenotypes using multiplexed amplicon sequencing. Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms. 2020. 25. 7. 498-509

MISC (59件)：

森宙史, 藤澤貴智, 東光一, 中村保一, 山田拓司, 松井求, 内山郁夫. 微生物バイオインフォマティクスの最前線マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指したMicrobiome Datahubの開発. 日本細菌学雑誌. 2023. 78. 1. 30-30
森宙史, 藤澤貴智, 東光一, 中村保一, 山田拓司, 松井求, 内山郁夫. マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指したMicrobiome Datahubの開発. 日本細菌学雑誌(Web). 2023. 78. 1
藤澤貴智, 平川英樹, 守屋勇樹, 信定知江, 金谷重彦, 有田正規, 田畑哲之, 磯部祥子, 東光一, 中村保一, et al. MicrobeDB.jpからMicrobiome Datahubへ: 微生物・植物・メタボロームのデータ統合と統合微生物データベースの再構築. トーゴーの日2022. 2022. 1
森宙史, 藤澤貴智, 西出浩世, 矢口貴志, 高橋弘喜, 中川善一, 山田拓司, 内山郁夫, 中村保一, 黒川顕. 微生物統合データベースMicrobeDB.jpを用いたマイクロバイオーム研究への応用. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2022. 16th (Web)
森宙史, 藤澤貴智, 西出浩世, 矢口貴志, 高橋弘喜, 中川善一, 山田拓司, 内山郁夫, 中村保一, 黒川顕. 微生物統合データベースMicrobeDB.jpと微生物群集解析. トーゴーの日2021. 2021. 1

書籍 (1件)：

A library of signature pentapeptides for the Protein Data Bank(共著)
Protein structure by distance analysis, IOS Press 1994

学位 (1件)：

博士(科学) (東京大学)

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