- 2023 - 2026 難培養性微生物の木質分解酵素の機能解明とバイオマス利用技術の基盤創出
- 2022 - 2025 シロアリ共生系を支える微生物相互作用の解明
- 2022 - 2024 新規乳酸菌の系統分類とバイオリソースの整備
- 2021 - 2024 火山性酸性河川の列島縦断調査による地表化学合成生態系の成立条件解明
- 2019 - 2022 シロアリ共生原生生物群集組成を規定する要因の解明
- 2019 - 2021 極限酸性河川における化学合成生物群集の生態と進化(分担)
- 2017 - 2020 シロアリの交雑がもたらす共生微生物群集の置換の過程と宿主に及ぼす影響の解析(分担)
- 2016 - 2019 シロアリの材食性を担う共生原生生物の遺伝子重複と木質分解能の関係
- 2016 - 2018 シロアリ腸内原生生物の細胞内共生スピロヘータ細菌のゲノム動態と種分化(分担)
- 2014 - 2017 Bacteroidales目細菌の窒素固定と水素利用の新機能の解明(分担)
- 2015 - 2016 シロアリの材食性を担う共生原生生物の系統と木質分解能の関係
- 2011 - 2015 シロアリの異種混合コロニーを用いたシロアリ共生微生物群集の成立過程の解析
- 2011 - 2014 シロアリの異種融合コロニーを用いたシロアリ共生微生物群集の成立過程の解明(分担)
- 2011 - 2013 食材性昆虫に共生する真核単細胞微生物の木質分解遺伝子の進化と生態
- 2011 - 2012 難培養真核微生物のゲノム系統学的解析
- 2011 - 2012 環境微生物の遺伝子重複と表現型進化
- 2007 - 2010 環境微生物の機能を指標としたイメージング
- 2008 - 第12回国際微生物生態学会大会(ISME-12)
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