- 2024 - 2027 近世庄屋日記の情報構造分析による民間アーカイブズのWEB公開
- 2023 - 2026 公儀触による両領国(徳川・国持外様)体制の最終検証と触研究への情報提供あり方研究
- 2022 - 2026 古代後半期の山寺の総合的探索にもとづく仏教浸透過程の研究
- 2020 - 2024 社会転換期における地域アーカイブズ全国調査の検証と新たな方法の開拓
- 2019 - 2024 障害の歴史性に関する学際統合研究 ー比較史的な日本観察ー
- 2020 - 2023 パンデミックの歴史研究に基づいたポストパンデミックの社会・環境理論の構築
- 2020 - 2023 公儀触伝達にみる徳川領国と国持外様領国の両領国体制の存在と構造-幕藩体制構造研究
- 2020 - 2023 モンスーンアジアの小農経済:産業革命期日本の環境史的地域研究
- 2018 - 2022 聖地・霊場の成立についての分野横断的比較研究
- 2018 - 2021 近世村落文書の目録再編成による地域情報の構造分析
- 2016 - 2021 日本列島における鷹・鷹場と環境に関する総合的研究
- 2014 - 2018 江戸期石高データに潜む数理構造の解明
- 2010 - 2015 人類の思想的営みとしての宗教遺産の形成に関する総合的研究 -宗教遺産学の構築へ-
- 2013 - 2015 近世村落における地域情報の調査・記録に関する比較研究
- 2010 - 2014 幕藩政アーカイブズの総合的調査・研究
- 2007 - 2010 近代移行期における地域情報とその蓄積過程に関する比較制度研究
- 2006 - 2007 日本近世宗門改制度に関する基礎的研究
- 1995 - 1999 ユーラシア社会の人口・家族構造比較史研究
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