- 2023 - 2028 先史人類による人為的環境形成(動物相)に関する研究
- 2022 - 2026 生命受容に基づく人間家畜相互関係の成立と深化に関する学融合的パラダイムシフト
- 2021 - 2026 アルメニア高地における初期農耕の北方適応の過程を探る
- 2022 - 2025 古代DNAと骨格形態から探る、東アジアにおけるイヌの家畜化と日本列島への導入
- 2020 - 2025 東南アジア大陸部における後期更新世人類の環境適応の解明
- 2021 - 2024 古代西アジアに生息した未知のライオンの研究
- 2019 - 2024 中東部族社会の起源:アラビア半島先原史遊牧文化の包括的研究
- 2020 - 2023 絶滅したニホンオオカミの遺伝的変遷と移動を探る動物考古学的研究
- 2019 - 2023 ポスト古代ゲノム解読期における家畜化概念のヒューマンアニマルボンド的学融合刷新
- 2018 - 2023 西アジア先史時代における生業と社会構造
- 2018 - 2022 西アジア新石器時代における社会の複雑化
- 2018 - 2021 定住狩猟採集民から農耕牧畜社会へ:ティグリス川上流域における4千年の過程を探る
- 2017 - 2021 ニホンオオカミとイヌとの交雑種?いわゆるヤマイヌの存在を探る動物考古学的研究
- 2015 - 2020 東南アジア大陸部における家畜化プロセスの総合的解明
- 2015 - 2020 モンゴル帝国成立基盤の解明を目指した考古学的研究
- 2014 - 2019 粘土板等土製品の分析から復元するイラクの環境史
- 2013 - 2018 「肥沃な三日月弧」の外側:遊牧西アジアの形成史に関する先史考古学的研究
- 2012 - 2017 西アジアにおける初期定住集落の研究
- 2012 - 2017 西アジア都市文明の資源基盤と環境
- 2012 - 2017 西アジア文明学の構築
- 2013 - 2016 アジア・インド洋圏家畜共存域における人動近接融合モデルの提唱
- 2013 - 2016 岩陰遺跡の環境考古学-先端手法による生業と古環境の高精度復元-
- 2011 - 2015 絶滅したエゾオオカミとニホンオオカミの起源と系譜を探る形態的および遺伝学的研究
- 2011 - 2015 イラクの塩害と砂漠化の環境史
- 2010 - 2015 モンゴル帝国成立史の解明を目指した環境考古学的研究
- 2010 - 2012 多起原的家畜化モデルの構築と学融合型資料収蔵システムの確立
- 2010 - 2012 古代東アジアと西アジアへの家畜馬の拡散に関する研究
- 2010 - 2012 アフロユーラシアにおける初期農耕・牧畜文化の比較研究
- 2010 - 2011 岩陰遺跡の生物考古学的研究-長野県北相木村ノンコ岩1遺跡の学際的調査
- 2008 - 2011 アジア大陸における乳文化圏の解明とアーカイブ構築
- 2008 - 2011 最終氷期以降の地球規模の気候変動事変に伴う古代遺跡周辺の水文環境の変動
- 2008 - 2010 西アジア新石器時代における社会システムの崩壊とその再編
- 2006 - 2009 インドネシアが分子進化上の起源地と推測される東アジアのイノシシ属の遺伝子調査
- 2006 - 2009 モンゴル帝国興亡史の解明を目指した環境考古学的研究
- 2005 - 2009 西アジア先史時代から都市文明社会への生業基盤の変化に関する動物・植物考古学的研究
- 2007 - 2008 アジア・インド洋圏の家畜化と狩猟誌に関する標本資料の恒久的安定化とその学際的解析
- 2006 - 2008 日本列島におけるブタ飼育開始過程およびウマ飼育に関する動物考古学的研究
- 2004 - 2007 アジア地域におけるオナガザル上科の進化に関する古生物学的研究
- 2004 - 2007 壁際廃屋葬の研究:西アジアにおける遊牧的適応の成立過程
- 2003 - 2006 西アジア先史時代におけるパイロテクノロジーの起源とその展開
- 2004 - 2005 日本犬の時代的変遷の総括と、日本人の変遷との関係についての研究
- 2003 - 2005 ユーラシア草原地帯東部における騎馬遊牧文化の成立に関する研究
- 2003 - 2005 古人骨の受傷痕と原因武器に関する研究
- 2003 - 2005 動物遺存体分析による西アジアのNeolithization(新石器化)過程の解明:家畜化の進行と遊牧の発生
- 2002 - 2005 東南アジア地域における第三紀霊長類の進化学的研究
- 2003 - 2004 中国の古代ブタの形質とその起源について
- 2002 - 2004 東アジアのイノシシ・ブタの遺伝的源流に位置するベトナムのイノシシ属の遺伝子調査
- 2000 - 2002 動物考古学的方法による日本、および周辺地域における古代家畜史の研究
- 2000 - 2002 Ancient DNA解析からみた日本在来犬の起源と分布に関する分子進化学的研究
- 2000 - 2002 動物遺存体分析による西アジア史再編:家畜化から遊牧的適応の成立まで
- 2000 - 2000 日本犬と弥生豚を中心とする在来家畜の渡来と系統に関する考古学的、分子遺伝学的研究
- 1996 - 2000 “Exploitation and domestication of animals in southeastern Turkey: The faunal remains from Neolithic Çayönü Tepesi”
- 1999 - 1999 日本犬と弥生豚を中心とする従来家畜の渡来と系統に関する考古学的、分子遺伝学的研究
- 1999 - Morphological study of Japanese macaques
- 1999 - 遺跡出土ニホンザルの形態的研究
- 1998 - 1998 日本犬と弥生豚を中心とする在来家畜の渡来と系統に関する考古学的,分子遺伝学的研究
- 1998 - 在来家畜(イヌ,ブタ)の渡来と系統に関する考古学的,分子遺伝学的研究
- 1998 - Zooarchaeological and genetic studies of Japanese dogs and pigs.
- 1996 - 中東地域における動物考古学的研究
- 1996 - Zooarchaeology in the Middle East
- 家畜の起源と系統に関する総合的研究
- Studies on Origin and Spread of domestic animals
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