松田秀雄

マツダヒデオ | Matsuda Hideo

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (2件)： https://www.ist.osaka-u.ac.jp/japanese/researcher/detail.php?id=154 , https://www.ist.osaka-u.ac.jp/english/researcher/detail.php?id=154

研究分野 (1件)：生命、健康、医療情報学

研究キーワード (3件)：バイオインフォマティクス , ゲノム情報解析 , 遺伝子ネットワーク

競争的資金等の研究課題 (38件)：

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論文 (186件)：

Yu Yamaoka, Weng Ian Chan, Shigeto Seno, Kanako Iwamori, So-ichiro Fukada, Hideo Matsuda. Quantifying the recovery process of skeletal muscle on hematoxylin and eosin stained images via learning from label proportion. Scientific Reports. 2024. 14. 1
Seiryo Watanabe, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda. A Novel Approach to Detection Algorithms for Artifacts in Clinical Endoscopy. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 18-26
Tomonori Tanei, Shigeto Seno, Yoshiaki Sota, Takaaki Hatano, Yuri Kitahara, Kaori Abe, nanae masunaga, Masami Tsukabe, Tetsuhiro Yoshinami, Tomohiro Miyake, et al. High HER2 Intratumoral Heterogeneity Is a Predictive Factor for Poor Prognosis in Early-Stage and Locally Advanced HER2-Positive Breast Cancer. Cancers. 2024. 16. 5
Keigo Masuda, Yoshiaki Sota, Hideo Matsuda. Accurate Detection of Fusion Genes in Long-Read Transcriptome Datasets from Multiple Cancer Cell Lines. Proceedings of the 2024 14th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics. 2024. 7-13
Ayaka Mori-Ichioka, Yosuke Sunada, Takashi Koikeda, Hideo Matsuda, Shinji Matsuo. Effect of applying Lactiplantibacillus plantarum subsp. plantarum N793 to the scalps of men and women with thinning hair: a randomized, double-blind, placebo-controlled, parallel-group study. Bioscience of Microbiota, Food and Health. 2024. 43. 3. 192-203

MISC (156件)：

川原崎聡子, 瀬尾茂人, 岡松優子, 高橋春弥, 野村亘, 神戸大朋, 木村和弘, 斉藤昌之, 松田秀雄, 井上和生, et al. UCP1レポーター脂肪細胞株を用いたβ-アドレナリンシグナル調節遺伝子の探索. 日本栄養・食糧学会大会講演要旨集. 2023. 77回. 267-267
川原崎聡子, 瀬尾茂人, 岡松優子, 高橋春弥, 野村亘, 神戸大朋, 木村和弘, 斉藤昌之, 松田秀雄, 井上和生, et al. レポーター脂肪細胞株を用いたβ-アドレナリン刺激応答性UCP1発現誘導調節遺伝子の探索. 肥満研究. 2022. 28. Suppl. 318-318
Sohta Nishida, Junko Yoshida, Shigeto Seno, Kyoji Horie, Hideo Matsuda. A clustering method based on cell type identification for single-cell RNA-seq data. The Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2022). 2022
川原崎聡子, 瀬尾茂人, 鄭惠芬, 高橋春弥, 野村亘, 神戸大朋, 松田秀雄, 井上和生, 河田照雄, 後藤剛. レポーター前駆脂肪細胞株を用いた新規UCP1発現調節遺伝子の探索. 肥満研究. 2022. 27. Suppl. 338-338
Toshiya Tanaka, Shigeto Seno, Hideo Matsuda. Feature selection with VAE for scRNA-seq analysis. The Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology / the European Conference on Computational Biology ISMB/ECCB 2021. 2021

特許 (2件)：

書籍 (4件)：

Transcription Factor Regulatory Networks: Methods and Protocols
Humana Press, Springer Science+Business Media 2014 ISBN:9781493908042
Microbial Gene Essentiality: Protocols and Bioinformatics
Humana 2008
バイオインフォマティクス事典
共立出版 2006
Genome Informatics Vol.12
Universal Academy Press 2001

講演・口頭発表等 (3件)：

Large-Scale Gene Regulatory Network Analysis for Adipocyte Differentiation on High-Performance Computer
(The 23rd International Conference on Genome Informatics (GIW2012) 2012)
Reconstruction of Gene Regulatory Networks for Drug Target Discovery
(The 3rd National Seminar and Workshop on Computer Aided-Drug Design: Virtual Screening (CADD2010) 2010)
Inference of Gene Regulatory Network for Cell Differentiations
(The Korean Society for Bioinformatics and Systems Biology (KSBSB) Summer School 2010 2010)

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (6件)：

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委員歴 (9件)：

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受賞 (7件)：

2024/10 - 日本バイオインフォマティクス学会日本バイオインフォマティクス学会賞遺伝子情報の大規模比較解析に関する先駆的研究
2021/03 - 日本農芸化学会 BBB論文賞 Long non-coding RNA 2310069B03Rik functions as a suppressor of Ucp1 expression under prolonged cold exposure in murine beige adipocytes
2014/09 - 情報処理学会シニア会員
2014/06 - 情報処理学会論文賞 A method for isoform prediction from RNA-Seq data by iterative mapping
2012/01 - Asia-Pacific Bioinformatics Conference 2012 Best Paper Award

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所属学会 (2件)：

情報処理学会 , 日本バイオインフォマティクス学会

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松田 秀雄