内古閑伸之

ウチコガノブユキ | Uchikoga Nobuyuki

所属機関・部署：
職名：特任准教授

研究分野 (1件)：生命、健康、医療情報学

研究キーワード (1件)：タンパク質間相互作用予測

競争的資金等の研究課題 (4件)：

論文 (22件)：

Guillaume Launay, Masahito Ohue, Julia Prieto Santero, Yuri Matsuzaki, Cécile Hilpert, Nobuyuki Uchikoga, Takanori Hayashi, Juliette Martin. Evaluation of CONSRANK-Like Scoring Functions for Rescoring Ensembles of Protein-Protein Docking Poses. Frontiers in molecular biosciences. 2020. 7. 308-559005
Yuri Matsuzaki, Nobuyuki Uchikoga, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Rigid-Docking Approaches to Explore Protein-Protein Interaction Space. NETWORK BIOLOGY. 2017. 160. 33-55
Uchikoga N, Matsuzaki Y, Ohue M, Akiyama Y. Specificity of broad protein interaction surfaces for proteins with multiple binding partners. Biophysics and Physicobiology. 2016. 13. 105-115
Ohue Masahito, Matsuzaki Yuri, Uchikoga Nobuyuki, Ishida Takashi, Akiyama Yutaka. 2P014 MEGADOCK: 超並列計算環境による大規模タンパク質間相互作用予測(01A. 蛋白質:構造,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度)). 生物物理. 2014. 54. 1. S197
Uchikoga Nobuyuki, Matsuzaki Yuri, Ohue Masahito, Akiyama Yutaka, Hirokawa Takatsugu. 2P271 Re-dockingによって正解候補構造が多く得られるタンパク質分子表面の特徴の解析(22A. 生命情報科学:構造ゲノミクス,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度)). 生物物理. 2014. 54. 1. S240

MISC (42件)：

Nobuyuki Uchikoga, Yuri Matsuzaki, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Interaction Surfaces of Proteins Involved in Bacterial Chemotaxis with Rigid-Body Docking Decoys. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 290A-290A
Yuri Matsuzaki, Jaak Simm, Nobuyuki Uchikoga, Yutaka Akiyama. A Docking Based Approach to Analyze Interaction Surfaces of Virus-Host Protein-Protein Interactions. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 451A-452A
Nobuyuki Uchikoga, Yuri Matsuzaki, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Analysis of Physico-Chemical Properties of Protein Docking Decoys Generated by Rigid-Body Docking. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2016. 110. 3. 327A-327A
Masahito Ohue, Yuri Matsuzaki, Nobuyuki Uchikoga, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. Megadock 4.0. An Ultra-High-Performance Protein-Protein Docking Software for Heterogeneous Supercomputers. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2016. 110. 3. 327A-327A
Nobuyuki Uchikoga, Masahito Ohue, Yuri Matsuzaki, Yutaka Akiyama. Post-docking analysis by physicochemical properties of protein-protein interactions generated from rigid-body docking processes. PROTEIN SCIENCE. 2015. 24. 253-253

書籍 (1件)：

講演・口頭発表等 (37件)：

Biophysical view of protein interaction surfaces
(低分子化合物とタンパク質の情報解析 2016)
Analysis of Physico-chemical properties of protein docking decoys generated by rigid-body docking
(Biophysical society 60th annual meeting 2016)
Re-docking by analyzing the profile of protein-protein interaction
(CBI学会2016年大会 2016)
MEGADOCK 4.0: an ultra-high-performance protein-protein docking software for heterogeneous supercomputers
(Biophysical society 60h annual meeting 2016)
タンパク質C末端に存在する機能未知配列に関する研究
(第15回日本蛋白質科学会年会 2015)

Works (3件)：

学歴 (4件)：

学位 (1件)：

経歴 (12件)：

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委員歴 (2件)：

2022 - 現在 Editorial Board : Frontiers in Bioinformatics (Protein Bioinformatics) Review Editor
2003 - 日本生物物理学会第41回日本生物物理学会年会実行委員

所属学会 (3件)：

日本生物物理学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , Biophysical Society

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内古閑 伸之