中川草

ナカガワソウ | Nakagawa So

所属機関・部署：
職名：准教授
ホームページURL (1件)： https://sites.google.com/site/sonakagawa/

研究分野 (5件)：生命、健康、医療情報学 , ウイルス学 , 遺伝学 , ゲノム生物学 , 進化生物学

研究キーワード (10件)：多重遺伝子族 , 人獣共通感染症 , メタゲノム , ウイルス進化 , 内在性レトロウイルス , レトロトランスポゾン , バイオインフォマティクス , レトロウイルス , 比較ゲノム , 分子進化

競争的資金等の研究課題 (15件)：

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論文 (115件)：

So Nakagawa, Shoichi Sakaguchi. Exploring the hidden world of RNA viruses with a transformer-based tool. Patterns. 2024. 5. 11. 101095
Kosuke Takada, So Nakagawa, Kirill Kryukov, Makoto Ozawa, Tokiko Watanabe. Metagenomic analysis of the gut microbiota of hooded cranes (Grus monacha) on the Izumi plain in Japan. FEBS Open Bio. 2024. 14. 12. 1972-1984
Kentaro Harakawa, Shinpei Kawarai, Kirill Kryukov, So Nakagawa, Shigeharu Moriya, Kazuhiko Imakawa. Buccal Swab Samples from Japanese Brown Cattle Fed with Limonite Reveal Altered Rumen Microbiome. Animals. 2024. 14. 13. 1968-1968
Ryo Yanagiya, Yuji Miyatake, Natsumi Watanabe, Takanobu Shimizu, Akane Kanamori, Masaya Ueno, Sachiko Okabe, Joaquim Carreras, Shunya Nakayama, Ami Hasegawa, et al. Amino acid influx via LAT1 regulates iron demand and sensitivity to PPMX-T003 of aggressive natural killer cell leukemia. Leukemia. 2024. 38. 8. 1731-1741
Ryo Yanagiya, So Nakagawa, Makoto Onizuka, Ai Kotani. Aberrant expression of Human Endogenous Retrovirus K9-derived elements is associated with better clinical outcome of acute myelocytic leukemia. 2024

MISC (91件)：

高田光輔, 大場靖子, 木田裕里恵, 呉佳齊, 小野慎子, 小野慎子, 松浦善治, 松浦善治, 中川草, 澤洋文, et al. SARS-CoV-2の下気道への広がる性質に関する遺伝子と適応進化. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2023. 25th
今西規, 木村亮介, 瀧靖之, 竹内光, 中川草, 安藤寿康. ヒトの顔形状の遺伝率推定と顔形状予測ソフトウエアの開発. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2023. 25th
平壮雄, 白石良樹, 高橋麻乃, 大野歩, 大野歩, 羽原拓哉, 中川草, 今西規. 定量性のある真菌叢解析を実現するための標準DNAの作製. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
今西規, 木村亮介, 瀧靖之, 竹内光, 中川草, 安藤寿康. ゲノム多型情報を使ったヒトの顔形状の予測. 霊長類研究. 2022. Supplement
上田真保子, 小野悠介, 隅山健太, 三橋里美, 三橋弘明, 中川草. 筋細胞の融合にかかわる内在性レトロウイルス由来の新規遺伝子. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2022. 24th

書籍 (27件)：

実験医学 2023年9月号 EVE研究に役立つデータベース
羊土社 2023 ISBN:9784758125710
実験医学 2022年4月号新型コロナウイルスのゲノム解析
羊土社 2022 ISBN:9784758125543
メタゲノムデータ解析 : 16Sも!ショットガンも!ロングリードも!菌叢解析が得意になる凄技レシピ
羊土社 2021 ISBN:9784758122559
ロングリードWET&DRY解析ガイド : シークエンスをもっと自由に! : リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術 : どこでも、誰でも、今日から使える!
羊土社 2021 ISBN:9784758122535
ヒト以外の遺伝子に関連する研究新型コロナウイルスのゲノム
(株)メディカルドゥ 2021 ISBN:9784909508126

講演・口頭発表等 (81件)：

大規模塩基配列データ解析によるRNAウイルス研究 - 新型コロナウイルスを含めて
(日本薬学会第144年会 2024)
SARS-CoV-2 HaploGraph: visualization of SARS-CoV-2 haplotypes spread in Japan
(DSWS-2023 2023)
大腸がんで発現するHERV由来タンパク質の局在と機能の解析
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
NeoRdRp 2.0: 新規大規模RdRpシード配列データセットによるパフォーマンスの向上
(日本微生物生態学会第36回大会 2023)
Dynamic Evolution of Retroviral Envelope Genes in Egg-Laying Mammalian Genomes
(ICGSK 2023 2023)

学歴 (2件)：

経歴 (7件)：

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委員歴 (5件)：

受賞 (10件)：

2024/09 - 日本遺伝学会 GGS PRIZE 2024 SARS-CoV-2 HaploGraph: visualization of SARS-CoV-2 haplotype spread in Japan
2024/05 - The International Virus Bioinformatics Meeting ViBioM 2024 Best Scientific Poster Award Virome analysis of metatranscriptome data using NeoRdRp
2023/09 - 日本遺伝学会研究奨励賞
2022/10 - 公益財団法人日本デザイン振興会グッドデザイン賞 8Kデータビジュアライゼーション [新型コロナウイルスの進化地図]
2022/08 - 一般社団法人可視化情報学会第33期学会賞(技術賞) 新型コロナウイルスゲノム系統樹の3次元可視化

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所属学会 (10件)：

可視化情報学会 , 日本微生物生態学会 , 生き物文化誌学会 , 日本ウイルス学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 日本分子生物学会 , 日本遺伝学会 , 日本進化学会 , Society for Molecular Biology and Evolution , 日本オミックス医学会

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

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