研究者

J-GLOBAL ID：201401036258474646 更新日: 2024年07月17日

高田彰二

タカダショウジ | Takada Shoji

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： http://theory.biophys.kyoto-u.ac.jp

研究分野 (1件)：生物物理学

競争的資金等の研究課題 (21件)：

2020 - 2025 ゲノムモダリティのマルチスケール理論
2021 - 2024 細胞内構造体解析に向けた次世代粗視化シミュレーション法の開発研究
2016 - 2019 複雑生体分子複合系の状態遷移経路の探索と制御に関する理論研究
2016 - 2018 ヌクレオソーム動構造とそのエピジェネティック制御の分子シミュレーション研究
2015 - 2017 クロマチン構造と共役した転写因子動態の分子シミュレーション研究

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論文 (225件)：

Suguru Kato, Shoji Takada, Sotaro Fuchigami. Particle Smoother to Assimilate Asynchronous Movie Data of High-Speed AFM with MD Simulations. Journal of Chemical Theory and Computation. 2023
Azuki Mizutani, Cheng Tan, Yuji Sugita, Shoji Takada. Micelle-like clusters in phase-separated Nanog condensates: A molecular simulation study. PLOS Computational Biology. 2023. 19. 7. e1011321-e1011321
Fritz Nagae, Shoji Takada, Tsuyoshi Terakawa. Histone chaperone Nap1 dismantles an H2A/H2B dimer from a partially unwrapped nucleosome. Nucleic Acids Research. 2023. 51. 11. 5351-5363
Yasuhiro Matsunaga, Sotaro Fuchigami, Tomonori Ogane, Shoji Takada. End-to-end differentiable blind tip reconstruction for noisy atomic force microscopy images. Scientific reports. 2023. 13. 1. 129-129
Takumi Washio, Xiaoke Cui, Ryo Kanada, Jun-ichi Okada, Seiryo Sugiura, Yasushi Okuno, Shoji Takada, Toshiaki Hisada. Using incomplete Cholesky factorization to increase the time step in molecular dynamics simulations. Journal of Computational and Applied Mathematics. 2022

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MISC (35件)：

高田彰二. 粗視化生体分子シミュレーション法. 生物物理(Web). 2021. 61. 3
高田彰二. 染色体はどのようにして折り畳まれるのか?2.分子動力学シミュレーションでみるクロマチン動態. 実験医学. 2018. 36. 17
WATANABE Shuhei, MISHIMA Yuichi, SUETAKE Isao, TAKADA Shoji. 粗視化シミュレーションによるヘテロクロマチン蛋白質1のヌクレオソームへの結合研究. 生物物理(Web). 2015. 55. Supplement 1-2
村上聡, 山根努, 池口満徳, 高田彰二. 計算科学と実験科学の組み合わせにより明らかになった多剤排出トランスポーターAcrBの分子メカニズム. 生物物理. 2015. 55. 1
松下慎二, SAFINYA Cyrus, 高田彰二. G0210202 ニューロフィラメントの力学挙動解析:粗視化分子動力学法による検討(バイオエンジニアリング部門一般セッション(2)). 年次大会 : Mechanical Engineering Congress, Japan. 2014. 2014. "G0210202-1"-"G0210202-2"

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書籍 (1件)：

タンパク質の立体構造入門 : 基礎から構造バイオインフォマティクスへ
講談社 2010 ISBN:9784061538818

学歴 (4件)：

1994 - 総合研究大学院大学博士(理学)
1990 - 1991 総合研究大学院大学数物科学研究科機能分子科学専攻博士後期課程
1988 - 1990 京都大学大学院理学研究科修士課程修了
1984 - 1988 京都大学理学部卒業

学位 (1件)：

博士(理学)

経歴 (6件)：

2013 - 現在京都大学理学研究科生物科学専攻生物物理教室教授
2007 - 2013 京都大学理学研究科生物科学専攻生物物理教室准教授
2001 - 2006 神戸大学理学部化学科助教授
1998 - 2001 神戸大学理学部化学科講師
1995 - 1998 日本学術振興会研究員(イリノイ大学化学科)

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