研究者

J-GLOBAL ID：201401084616735532 更新日: 2024年10月23日

中岡慎冶

ナカオカシンジ | Nakaoka Shinji

所属機関・部署：
職名：准教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

独立行政法人理化学研究所医科学イノベーションハブ推進プログラム客員研究員

ホームページURL (2件)： http://petadimension.org/ , http://altair.sci.hokudai.ac.jp/infmcb/index-e.html

研究分野 (4件)：生命、健康、医療情報学 , 計算科学 , 応用数学、統計数学 , 数学基礎

研究キーワード (5件)：数理生物学 , システム生物学 , バイオインフォマティクス , 免疫系 , 力学系

競争的資金等の研究課題 (14件)：

2021 - 2024 エネルギー地形に基づくデータ駆動型状態遷移モデルの構築
2021 - 2024 数理科学と医療管理学を融合した新興感染症の推計モデルと医療資源配分手法の開発
2021 - 2024 PHRを活用した機械学習モデルによる心血管病の重症化予防を目指した研究
2020 - 2023 ハナバチ保全のための新興疾病の統合的リスク評価
2018 - 2021 包括的マルチオミクス解析によるウイルス感染ダイナミクスの時空間的理解

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論文 (85件)：

Chizuru Kimura, Kazuhito Miura, Yutaka Watanabe, Haruhisa Baba, Kimiya Ozaki, Akira Hasebe, Tokiyoshi Ayabe, Kiminori Nakamura, Shinji Nakaoka, Katsuhiko Ogasawara, et al. Association between oral frailty and Prevotella percentage in the oral microbiota of community-dwelling older adults who participated in the CHEER Iwamizawa project, Japan. Journal of oral rehabilitation. 2024. 51. 9. 1721-1729
Kosaku Kitagawa, Kwang Su Kim, Masashi Iwamoto, Sanae Hayashi, Hyeongki Park, Takara Nishiyama, Naotoshi Nakamura, Yasuhisa Fujita, Shinji Nakaoka, Kazuyuki Aihara, et al. Multiscale modeling of HBV infection integrating intra- and intercellular viral propagation to analyze extracellular viral markers. PLOS Computational Biology. 2024. 20. 3. e1011238-e1011238
Kaiyang Zhang, Shinji Nakaoka. An energy landscape approach reveals the potential key bacteria contributing to the development of inflammatory bowel disease. PloS one. 2024. 19. 6. e0302151
Asami Yamada, Jun-Ichirou Yasunaga, Lihan Liang, Wenyi Zhang, Junya Sunagawa, Shinji Nakaoka, Shingo Iwami, Yasunori Kogure, Yuta Ito, Keisuke Kataoka, et al. Anti-HTLV-1 immunity combined with proviral load as predictive biomarkers for adult T-cell leukemia-lymphoma. Cancer science. 2023. 115. 1. 310-320
Daiki Kumakura, Ryo Yamaguchi, Akane Hara, Shinji Nakaoka. Disentangling the growth curve of microbial culture. Journal of Theoretical Biology. 2023. 573. 111597-111597

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MISC (33件)：

張瀚天, 中岡慎治, 安東弘泰. Effect of shapes of activation functions on predictability in the echo state network (複雑コミュニケーションサイエンス). 電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報. 2019. 119. 157. 27-30
中岡慎治, 鈴木憲幸, 竹内康博. 細菌群集データから相互作用ネットワークを推定する手法の活用 (複雑コミュニケーションサイエンス). 電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報. 2019. 119. 157. 23-25
柿添友輔, 岩本将士, 中岡慎治, 渡士幸一, 岩見真吾. 培養細胞におけるB型肝炎ウイルス感染動態の定量化 (第14回生物数学の理論とその応用 : 構造化個体群ダイナミクスとその応用). 数理解析研究所講究録. 2018. 2087. 71-76
原朱音, 中岡慎治, 合原一幸. アレルギー発症に関わる腸内細菌叢のビッグデータ解析. 生産研究. 2018. 70. 3. 141-144
柿添友輔, 中岡慎治, 岩見真吾. HIV-1侵入機構の定量化 (第13回生物数学の理論とその応用 : 連続および離散モデルのモデリングと解析). 数理解析研究所講究録. 2017. 2043. 81-86

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書籍 (1件)：

進化のダイナミクス生命の謎を解き明かす方程式
共立出版 2008 ISBN:4320056655

学歴 (4件)：

2004 - 2007 静岡大学大学院理工学研究科システム科学専攻
2002 - 2004 大阪府立大学大学院工学研究科数理情報学専攻(数理工学分野)
1998 - 2002 大阪府立大学工学部数理工学科
1995 - 1998 大阪府立三国丘高校

学位 (1件)：

博士(理学) (静岡大学)

経歴 (11件)：

2021/03 - 現在北海道大学大学院先端生命科学研究院数理生物学教室准教授
2016 - 2018 科学技術振興機構さきがけ専任研究員
2018 - 北海道大学大学院先端生命科学研究院特任講師
2016 - 2016 東京大学生産技術研究所特任助教
2014 - 2016 東京大学大学院医学系研究科助教

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委員歴 (1件)：

2017 - 2018 日本数理生物学会事務局

受賞 (1件)：

2009/09 - 日本数理生物学会若手研究奨励賞

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