- 2020 - 2025 RNAを基盤とする合成生命システムの創成
- 2020 - 2021 マイクロRNAによる全能性・多能性制御機構の解明
- 2020 - 2021 RNAネットワーク制御に基づく人工遺伝子回路の構築と細胞プログラミング
- 2020 - 2021 プログラム可能な動的微粒子群「オートマター」の創成と展開
- 2019 - 2021 大規模RNA構造ライブラリを活用した真のRNA高次構造エレメントの解明
- 2018 - 2020 軟骨細胞系譜における分化段階特異的翻訳制御機構の解明
- 2017 - 2020 人工RNAを活用した高効率・汎用的な細胞リプログラミング技術の確立
- 2015 - 2020 人工RNPナノシステムを活用した細胞プログラミング技術の創出
- 2017 - 2019 ncRNA構造ライブラリを基盤とする大規模作動エレメント解析技術の開発
- 2015 - 2018 人工分子デバイス援用による新世代人工細胞
- 2012 - 2017 核酸ナノ構造を活用した多元分子情報変換デバイスの創成
- 2012 - 2017 分子ロボティクスの支援と広報
- 2015 - 2016 マイクロRNAスイッチを活用した標的細胞の識別及び運命制御
- 2013 - 2016 細胞質因子検出 RNA 回路による細胞分画法の開発
- 2011 - 2016 人工遺伝子回路の機能向上のための進化分子工学による生体分子の改良
- 2011 - 2015 RNAとタンパク質の相互作用を用いたヒト細胞運命制御システムの構築
- 2011 - 2014 シンセティックバイオロジーを活用した細胞機能制御技術の開発
- 2011 - 2012 自己複製能をもつRNA酵素を基盤とした人工生命体モデルの創出
- 2007 - 2008 RNAネットワークを内包した人工細胞の創成
- 2006 - 2008 シンセティック・バイオロジーによる人工RNP複合体及びシステム進化系の構築
- 2006 - 2008 RNPによる人工遺伝子ネットワークの試験管内進化
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