- 2018 - 2021 バクテリアのメチロームによる表現型多様化メカニズムの解明
- 2017 - 2018 簡便・柔軟・ポータブルな特定 DNA 配列検出システムの開発
- 2017 - 2018 TALE-RNAポリメラーゼ複合体によるDNA配列検出系の開発
- 2017 - 2018 バクテリアのゲノム修飾による遺伝子発現制御メカニズムの網羅的解析
- 2016 - 2016 メチローム選択系による複雑な形質のメカニズム解析
- 2013 - 2016 エピゲノムのデジタル変換による適応進化:オーミクスと実験進化による検証
- 2014 - 2016 ランダムメチローム選択系を用いた適応進化機構のマルチオーミクス解析とその応用
- 2012 - 2013 配列特異的DNAメチル化酵素によるエピゲノム工学:合成生物学・ゲノム工学の拡張へ
- 2012 - 2013 ゲノム比較による細菌病原性の進化の解明
- 2009 - 2011 多様な利己的DNaseがゲノム切断で作り出す生・死・進化の分岐点
- 2011 - パーソナルピロリ菌ゲノム解析のためのフレームワーク構築
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