笠原浩太

カサハラコウタ | KOTA KASAHARA

ホームページURL (1件)： http://ktkshr.net

研究分野 (1件)：生物物理学

研究キーワード (1件)：バイオインフォマティクス、パターン認識、分子シミュレーション、分子動力学法、蛋白質、天然変性、イオンチャネル、理論的創薬、転写因子、翻訳後修飾、蛋白質デザイン

競争的資金等の研究課題 (4件)：

論文 (44件)：

Shin-Ichiro Yamaguchi, Qilin Xie, Fumiya Ito, Kazuki Terao, Yoshinobu Kato, Miki Kuroiwa, Satoshi Omori, Hideo Taniura, Kengo Kinoshita, Takuya Takahashi, et al. Carbon nanotube recognition by human Siglec-14 provokes inflammation. Nature nanotechnology. 2023
Toru Sengoku, Masaaki Shiina, Kae Suzuki, Keisuke Hamada, Ko Sato, Akiko Uchiyama, Shunsuke Kobayashi, Asako Oguni, Hayato Itaya, Kota Kasahara, et al. Structural basis of transcription regulation by CNC family transcription factor, Nrf2. Nucleic Acids Research. 2022. 50. 21. 12543-12557
Tomomi Ukawa, Fumihiko Banno, Toshiki Ishikawa, Kota Kasahara, Yuuta Nishina, Rika Inoue, Keigo Tsujii, Masatoshi Yamaguchi, Takuya Takahashi, Yoichiro Fukao, et al. Sphingolipids with 2-hydroxy fatty acids aid in plasma membrane nanodomain organization and oxidative burst. Plant Physiology. 2022. 189. 2. 839-857
Shun Sakuraba, Qilin Xie, Kota Kasahara, Junichi Iwakiri, Hidetoshi Kono. Extended ensemble simulations of a SARS-CoV-2 nsp1-5’-UTR complex. PLOS Computational Biology. 2022. 18. 1. e1009804-e1009804
Tomonori Hayami, Narutoshi Kamiya, Kota Kasahara, Takeshi Kawabata, Jun-ichi Kurita, Yoshifumi Fukunishi, Yoshifumi Nishimura, Haruki Nakamura, Junichi Higo. Difference of binding modes among three ligands to a receptor mSin3B corresponding to their inhibitory activities. Scientific Reports. 2021. 11. 1

MISC (2件)：

Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Han Wang, Kota Kasahara, Haruki Nakamura. Development and application of novel non-Ewald methods for calculating electrostatic interactions in molecular simulations. PROTEIN SCIENCE. 2015. 24. 290-290
Matsuyuki Shirota, Susumu Chiba, Kota Kasahara, Kengo Kinoshita. Exploring the proton permeation pathway by using homology modeling and molecular dynamics simulation of the Hv1 proton channel. JOURNAL OF PHYSIOLOGICAL SCIENCES. 2013. 63. S55-S55

書籍 (3件)：

講演・口頭発表等 (39件)：

タンパク質間相互作用メカニズムの解明に向けたアミノ酸N-gram 統計解析
(第16回日本蛋白質科学会年会 2018)
ポリグルタミン酸のへリックスコイル転移における末端の安定性に関する分子動力学法による検討
(第55回日本生物物理学会年会 2017)
レプリカ交換分子動力学シミュレーションによる酸性条件下でのポリグルタミン酸の最安定構造
(第55回日本生物物理学会年会 2017)
機械学習を用いたタンパク質と薬のドッキング予測
(第55回日本生物物理学会年会 2017)
拡張アンサンブル分子動力学法のサンプリング効率向上のための最適条件の探索
(第55回日本生物物理学会年会 2017)

学歴 (4件)：

学位 (1件)：

経歴 (3件)：

所属学会 (3件)：

日本バイオインフォマティクス学会 , 日本生物物理学会 , 日本蛋白質科学会

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