山上龍太

ヤマガミリョウタ | Yamagami Ryota

所属機関・部署：
職名：特任講師

研究分野 (4件)：生物物理学 , 分子生物学 , 機能生物化学 , 生体化学

研究キーワード (5件)：リボザイム , Translation , RNA folding , tRNA , RNA

競争的資金等の研究課題 (12件)：

2023 - 2028 ストレス応答に伴う細胞内tRNAの質的変動を新たな手法で解明する
2024 - 2025 RNAの構造によるエピトランスクリプトーム制御機構の解明
2023 - 2025 細胞癌化に伴う細胞内tRNAの質的変動解析と診断マーカーへの応用
2022 - 2025 tRNA修飾酵素の新規標的RNAを効率的に同定する技術開発とその応用
2023 - 2024 核酸触媒を利用した金属イオンセンサーの開発

全件表示

論文 (27件)：

Ryota Yamagami, Hina Kubota, Emi Kohno, Hiroyuki Hori. High-Throughput Mutational Analysis of a Methyltransferase Ribozyme. Frontiers in RNA Research. 2024. in press
Teppei Matsuda, Hiroyuki Hori, Ryota Yamagami. Rational design of oligonucleotides for enhanced in vitro transcription of small RNA. RNA. 2024. 30. 1-18
Yoh Kohno, Asako Ito, Aya Okamoto, Ryota Yamagami, Akira Hirata, Hiroyuki Hori. Escherichia coli tRNA (Gm18) methyltransferase (TrmH) requires the correct localization of its methylation site (G18) in the D-loop for efficient methylation. Journal of biochemistry. 2023. 175. 1. 43-56
McCauley O Meyer, Ryota Yamagami, Saehyun Choi, Christine D Keating, Philip C Bevilacqua. RNA folding studies inside peptide-rich droplets reveal roles of modified nucleosides at the origin of life. Science advances. 2023. 9. 38. eadh5152-15
McCauley O Meyer, Ryota Yamagami, Saehyun Choi, Christine D Keating, Philip C Bevilacqua. RNA folding studies inside peptide-rich droplets reveal roles of modified nucleosides at the origin of life. bioRxiv : the preprint server for biology. 2023

MISC (5件)：

内上祐介, 山上龍太, 安部真人, 田島茂, 林昌宏, 海老原秀喜, 好井健太朗, 堀弘幸, VASUDEVAN Subhash G, 澤崎達也, et al. コムギ無細胞系で合成したDENVポリプロテインの複製複合体再構成に向けた生化学的評価. 日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web). 2023. 70th
内上祐介, 江村祐希, VASUDEVAN Subhash G., 安部真人, 山上龍太, 堀弘幸, 高橋宏隆, 澤崎達也. コムギ無細胞系を用いたDENVポリプロテインの合成と複製複合体再構成に向けた酵素活性評価. 日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web). 2022. 69th
越智杏奈, 真壁幸樹, 山上龍太, 平田章, 坂口怜子, HOU Ya-Ming, 渡辺和則, 濡木理, 桑島邦博, 堀弘幸. トポロジカルノット型tRNAメチル化酵素(TrmH)の触媒ドメインによる基質tRNAと基質にならないtRNAの識別. 日本RNA学会年会要旨集. 2014. 16th
山上龍太, 山下光輝, 西増弘志, 冨川千恵, 越智杏奈, 岩下智香子, 平田章, 石谷隆一郎, 濡木理, 堀弘幸, et al. 葉酸依存性tRNA(m⁵U54)メチル化酵素TrmFOはどうやってtRNA中のU54を認識しているのか?. 日本RNA学会年会要旨集. 2013. 15th
山上龍太, 山下光輝, 西増弘志, 冨川千恵, 越智杏奈, 岩下智香子, 平田章, 石谷隆一郎, 濡木理, 堀弘幸, et al. サーマス・サーモフィラス由来tRNAメチル化酵素TrmFOの基質認識機構. 日本RNA学会年会要旨集. 2012. 14th

講演・口頭発表等 (75件)：

次世代シーケンスを用いたRNA修飾の検出とその応用
(遺伝研研究会「エピトランスクリプトーム制御の分子機構と生理機能」 2024)
Thermus thermophilus transfer-messenger RNAにシュードウリジンは存在するのか?
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
Characterization of tRNA methyltransferase Trm14 from a hyper-thermophilic archaeon, Thermococcus kodakarensis
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
Thermus thermophilus 16S rRNAアンチ・シャインダルガーノ配列領域の 2つのシュードウリジン修飾の責任酵素の探索
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
Biochemical analyses of Lys transfer reaction by ArcS-RaSEA complex
(第46回日本分子生物学会年会 2023)

学位 (1件)：

博士(工学) (愛媛大学)

経歴 (7件)：

2024/04 - 現在愛媛大学大学院理工学研究科特任講師
2021/04 - 2024/03 愛媛大学大学院理工学研究科助教
2019/04 - 2021/03 日本学術振興会海外特別研究員 (ペンシルバニア州立大学)
2016/04 - 2021/03 ペンシルバニア州立大学ポストドクトラルフェロー
2017/01 - 2017/12 上原記念生命科学財団海外リサーチフェロー

全件表示

受賞 (6件)：

2023/05 - 日本生化学会中国四国支部第64回日本生化学会中国四国支部例会若手優秀発表賞 Transfer RNAの構造予測法の開発とその応用
2022/11 - 愛媛大学愛媛大学生物科学奨励賞
2021/06 - RNA Society RNA2021 NSF Award
2019/06 - RNA Society RNA2019 Travel award
2017/01 - 公益財団法人上原記念生命科学財団海外留学助成リサーチフェローシップ細胞内RNAフォールディング機構の解明と応用

全件表示

所属学会 (3件)：

RNA society , 日本RNA学会 , 日本分子生物学会

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

前のページに戻る

山上 龍太

山上龍太